L'horloge circadienne

Résumé du document

Les recherches effectuées ici ont un but agronomique. Elles permettent de comprendre le fonctionnement de l'horloge circadienne qui régule divers phénomènes tels que la floraison ou l'utilisation de l'eau… La compréhension de ces rythmes nous autoriserait plus tard à contrôler le moment même de la floraison selon le climat.
Les gènes intervenant dans le fonctionnement de l'horloge ont déjà été identifiés mais leur mode d'action reste encore mal connu. Ainsi, on met en place des mutants pour ces gènes primordiaux et on cherche à évaluer l'impact de ces différentes mutations sur les rythmes circadiens. On affine donc à chaque expérience notre perception du rôle de ces gènes dans le fonctionnement de l'horloge circadienne.
A terme, on pourra produire des semences OGM capable de se développer à des températures supérieures aux températures optimales actuelles. Cela représente donc un intérêt certain dans le contexte du réchauffement climatique

Extraits

[...] En général, les parties sélectionnées le sont sur un laps de 80 heures ce qui permet d'obtenir environ 3 mouvements nets des feuilles. Conclusion Sur la page suivante apparaissent les résultats de l'expérience que j'ai menée. Sur ces schémas les mutants sont figurés par des triangles blancs et les génotypes sauvages par des carrés noirs. Sur cette figure, on voit le changement de période de l'horloge circadienne en fonction de la température. On constate que les Arabidopsis de génotype sauvage arrivent à maintenir une période d'environ 24h sur la frange de températures allant de 12 à 27°C. [...]

[...] Il existe une deuxième manière d'inhiber certains gènes, il s'agit de faire pénétrer un intron au niveau de la séquence codante du gène et alors il ne sera plus transcrit. Dans ce cas là, il est complètement inhibé. Cela est actuellement possible car le génome d'Arabidopsis thaliana est entièrement connu. Cette manipulation se fait dans une entreprise indépendante, il suffit de commander les graines désirées. Une autre méthode de modification du génome est l'ajout de caractères. C'est cette solution qui a été choisie et appliquée lors de mon stage. Cela est possible grâce à des bactéries : les agrobactéries. [...]

[...] Ce schéma montre the relative amplitude error en fonction des périodes. Cela permet d'estimer the rhythm robustness. Plus la valeur de l'amplitude est élevée moins le rythme est robuste. A 17 et les rythmes sont bien marqués à la fois pour le wt (wild type) et pour gi11 (mutant). Mais lorsque les températures s'éloignent de l'optimum, les périodes du mutant deviennent plus aléatoires (comme le montre la dispersion des valeurs de l'amplitude). En conclusion, le mutant et le type sauvage sont capables de maintenir des périodes robustes d'environ 24h aux températures optimales et mais à 12°C et le rythme des mouvements des feuilles (et donc celui de l'horloge circadienne) devient variable et moins robuste. [...]

[...] Ainsi pendant une semaine, toutes les 20 minutes les caméras enregistreront des photos des boites et transmettront ces données vers un moniteur central qui les stocke. On assiste alors au développement des premières feuilles qui par leurs mouvements illustrent le rythme circadien. VI. Analyse A la fin de l'expérience, on récupère les données que l'on garde sur un DVD et on les analyse à l'aide de divers logiciels informatiques. Dans un premier temps, on ouvre les photos à partir d'un logiciel nomme Metamorph. [...]

[...] Deuxième port à l'exportation du Royaume-Uni, elle possède encore une industrie significative. Ses industries comportent des produits pharmaceutiques, des équipements électriques, des produits agroalimentaires. Des usines de construction automobile et des raffineries de pétrole sont situées à la périphérie de l'agglomération. La ville est célèbre internationalement pour avoir vu naître les Beatles parmi toute une génération de groupes appelés collectivement Mersey beat. La ville possède deux clubs de football en première division anglaise. La ville s'est réorientée vers la culture et doit devenir ville Européenne de la culture en 2008. [...]