Les flores bactériennes

Résumé du document

Structure bactérienne :
- Bactéries: micro-organismes unicellulaires
- Procaryotes
- Archaea (Bactéries primitives) / Bacteria (en pathologie)
- Diamètre 1 um, visibles au microscope optique
- Formes :
. Cocci (sphériques)
. Bacilles (bâtonnets) : droits , incurvés , spiralés

Extraits

[...] Flores bactériennes Rappels Structure bactérienne : Bactéries = micro-organismes unicellulaires Procaryotes Archaea (Bactéries primitives) / Bacteria (en pathologie) Diamètre 1 μm, visibles au microscope optique Formes : Cocci (sphériques) Bacilles (bâtonnets) : droits , incurvés , spiralés Au microscope électronique : Cytoplasme avec ribosomes, un chromosome plasmides Membrane cytoplasmique Paroi : structure rigide , forme des bactéries , constante (sauf chez les mycoplasmes) , structure variable , Gram positif et négatif Peptidoglycane ou PEG = macromolécule de chaînes polysaccharidiques reliées entre elles par des peptides Gram + : acides teichoiques et lipoteichoiques Gram - : Membrane externe, LPS (lipopolysaccharide), porines Espace périplasmique entre la membrane cytoplasmique et le PEG Capsule entoure la bactérie : nature polysaccharidique , rôle important dans le pouvoir pathogène en empêchant la phagocytose Appendices : Flagelles de nature protéique (mobilité) Pili ou Fimbriae (interactions avec cellules eucaryotes) Spores Persistance dans l'environnement Pas de mitochondries Caractère haploïde de son génome Classification des bactéries : caractères phénotypiques (morphologie , propriétés biochimiques , nature des Ag de surface ) et génotypiques (génome , ARN 16S ) Groupement en famille puis genre puis espèce Aérobie/Anaérobie Gram + : Cocci : Staphylocoque , Streptocoque , Pneumocoque , Entérocoque Bacilles : Listeria , Corynebactéries , Bacillus Gram - : Cocci : Neisseria, Méningocoque , Gonocoque , B.catarrhalis Bacilles : Entérobactéries (E.coli) , P.aeruginosa , Haemophilus , Campylobacter , Legionella , Bordetella pertussis Anaérobie strict : Gram + : Cocci : Pepto- streptococcus Bacilles : Clostridium , Bifidobacterium , Actinomyces , Lactobacille , Propionibacterium Gram - : Cocci : Veillonella Bacilles : Bacteroides , Prevotella , Porphyromonas , Fusobacterium R éservoirs bactériens : Flore environnementale : bactéries saprophytes rarement responsables d'infection Réservoir : eau, surface , air Responsable d'infections : légionellose , infections des plaies avec Pseudomonas Flores commensales : Réservoir : l'homme est constitué de 1000 milliards (10 12) de cellules eucaryotes , et porteur de milliards (1014) de bactéries Flore normale = bactéries présentes sur la peau et les muqueuses des sujets sains Caractéristique de chaque espèce animale Acquise à la naissance : fœtus stérile , contamination par flore vaginale lors de l'accouchement Dépendante de facteurs (alimentation, environnement) En équilibre avec l'organisme II) Les 4 grandes flores normales de l'Homme Flore cutanée : Peau = épithélium épais Barrière infranchissable , et pourtant : vie microbienne importante Partie externe de la peau Follicules pileux Glandes sébacées Jamais dans les glandes sudoripares (pH ni dans le derme sauf en cas d'effraction Toutes les régions du corps ne sont pas également colonisées : densité bactérienne varie en fonction de la concentration en sébum , la pilosité et l'hygiène de vie Zones humides chaudes : aisselles, face interne des cuisses riches en bactéries Zones exposées à l'air : pli du coude, sternum, abdomen peu colonisés mains portent souvent une flore transitoire Rôle de protection (effet barrière) Bactéries : Bactéries à Gram + : S.epidermidis, Propionibacterium acnes , Microcoques, Corynebactéries , S.aureus ( narines, aisselles et périnée) Bactéries à Gram - : Acinetobacter NB : peu ou pas de Bacilles à Gram négatif, ni de Pseudomonas (flore transitoire) Flore oropharyngée : Cavité buccale : Écosystème bactérien constant, remarquable Bactéries aérobies et anaérobies Plus 300 espèces bactériennes Flore riche 105 à 106 bactéries/ml salive bactéries/g plaque dentaire Bactéries : Streptocoques a hémolytiques , Staphylococcus epidermidis , Corynebactéries, Lactobacilles , Neisseria (cocci à Gram négatif) , Bacilles à Gram négatif (Haemophilus) NB : Entérobactéries et Pseudomonas : exceptionnel Nez : L'entrée des fosses nasales = zone de passage avec la peau Flore cutanée humide (S.aureus) Puis structure différente = flore différente (cloison, cornet, cavum) Bactéries : Streptocoques (Pneumocoques) , Haemophilus influenzae , Moraxella catarrhalis Sinus = stériles Oeil : balayage permanent donc peu de germes Bronches : stérile sou pauci-bactérien nes Flore intestinale : Gram + (30-40% ) et Gram - Œsophage : voie de passage des aliments , flore peu importante Estomac : pH flore très pauvre (10 b/ml) voir inexistante provient de la flore contenue dans les aliments , Streptocoques, Lactobacilles , sauf Helicobacter pylori Duodénojejunum : flore transitoire 104 à 105 b/g contenu intestinal , Streptocoques, Lactobacilles Iléon : flore plus abondante , Streptocoques, Lactobacilles , Anaérobies (Bacteroides) Colon : flore colique très abondante à 1010 B/g selles , anaérobies (Bacteroides) et aérobies (E.coli) Flore fécale : Anaérobies à Gram négatif 1011 flore dominante Anaérobies à Gram positif 1010 A érobies Gram négatif 109 (E.coli) flore sous dominante Aérobies Gram positif 1010 (Entérocoques ) flore sous dominante Flore de transit : Staphylocoques, Pseudomonas, Entérobactéries autres que E.coli, Candida Flore vaginale : Flore riche : Bacilles et Cocci à Gram positif aérobies et anaérobies Elle est influencée par la nature de l'épithélium , les hormones oestrogènes et la concentration en glycogène A la naissance, le vagin est stérile , puis colonisation rapide par Lactobacilles, Bifidobacterium (flore de Döderlein) pH bas (métabolisme des bactéries et glycogène) : chez la fillette et la femme ménopausée absence de glycogène et de sécrétion d'œstrogène pH vaginal entre 6 et 7 III) Relation hôte-bactérie Implantation de la flore normale : Adhésion bactérienne = capacité pour la bactérie de s'attacher à une surface présence d'adhésines et cellules épithéliales Adhésines : appendices filamenteux , fimbriae, formes polymorphes (glycocallix) Support cellulaires : Glycolipides et glycoprotéines Spécificité étroite des récepteurs : d'hôte et d'espèce bactérienne Interférence bactérienne = capacité pour certaines bactéries de modifier l'implantation d'une autre espèce Inhibition d'une espèce bactérienne par synthèse d'une substance Streptocoques (pouvoir inhibiteur), S.aureus, bactériocines Inhibition due à une compétition / récepteurs cellulaires Facilitation de l'implantation d'une espèce Interférence /adhésion : bactéries servent de relais entre les récepteurs d'une surface et ceux d'une autre bactérie Processus de clairance bactérienne : plusieurs mécanismes d'élimination bactérienne Desquamation cellulaire Mouvements musculaires augmentent la clairance des bactéries / muqueuses (mastication) Flux unidirectionnels (salive, urine) Au niveau de l'arbre trachéobronchique, mouvements de l'épithélium cilié, les réflexes de toux empêchent la colonisation Défenses plus spécifiques (phagocytose, lysozyme, Ig) Variation de pH (intestin, vagin) Rôle de la flore commensale : Rôle de défense : dans le contrôle des infections , dans la régulation de l'immunité Participe au maintien de la santé : exemple flore intestinale , synthétise vitamine K , aide à l'absorption des aliments , prévient par son équilibre la prolifération des bactéries commensales potentiellement dangereuses , gêne la colonisation par des bactéries pathogènes Elles sont indispensables à notre survie Origine des infections : On distingue : Bactéries pathogènes strictes : Salmonella typhi (fièvre typhoïde), Mycobacterium tuberculosis (Tuberculose) Bactéries occasionnellement pathogènes : bactéries de la flore commensale capables de provoquer une maladie chez un sujet dont les mécanismes de défense sont normaux Bactéries opportunistes : certaines bactéries peuvent devenir pathogènes lorsque les défenses de l'hôte sont affaiblies Notions de pouvoir pathogène et de virulence : Pouvoir pathogène ou pathogénicité d'une bactérie = ensemble des mécanismes conditionnant le type de maladie dépendant d'une bactérie (notion qualitative) Virulence = capacité de la bactérie à déclencher une maladie infectieuse. [...]