Diarrhées bactériennes, flore digestive, coproculture, diarrhées infectieuses, selles
Prescription d'une coproculture :
- Si selles liquides
- Après interrogatoire minutieux
Renseignements obligatoires avec prélèvement
Orientation des recherches en fonction : âge, diarrhée dans l'entourage , origine géographique, voyage récent, antibiothérapie
Prescription : bon de demande , renseignements
Prélèvement : recueil de selles fraîches en flacon propre, écouvillonnage rectal
Transport : acheminement rapide (ensemencement dans les 2h) , conservation 12-24h à +4°
Coproculture standard: Salmonella , Shigella , Campylobacter , Yersinia, Coproculture orientée
[...] coli entéro-toxinigène (ETEC, turista) Modèle entérotoxinogène (synthèse d'une entérotoxine) : fuite liquidienne et électrolytes , muqueuse intestinale reste intègre Selles très aqueuses et abondantes, fièvre inhabituelle, absence de sang et de leucocytes dans les selles Complication : déshydratation Syndrome dysentérique = Shigella dysenteriae , E. coli entéro-invasif (EIEC) Modèle invasif : capacité de lyse cellulaire + toxine , destruction de la muqueuse intestinale , réaction inflammatoire Selles afécales (glairo-sanglantes) , fièvre , présence de sang et de leucocytes dans les selles Complication : diffusion extra-intestinale Syndrome gastro- entérique / entérocolite Diarrhée à tendance aqueuse fièvre Tableaux les plus fréquents en France : diarrhées banales Enterocolite plutôt cholériforme = E. [...]
[...] aureus , Clostridium perfringens Diagnostic : Recherche de toxines à partir des selles, des aliments, et du liquide gastrique dans des laboratoires spécialisés Isolement de la bactérie (coproculture standard pour la plupart) Coproculture : en pratique Phase pré-analytique : Prescription : bon de demande , renseignements Prélèvement : recueil de selles fraîches en flacon propre , écouvillonnage rectal Transport : acheminement rapide (ensemencement dans les 2h) , conservation 12-24h à Coproculture standard = Salmonella , Shigella , Campylobacter , Yersinia Coproculture orientée Patient en aplasie : P. aeruginosa, Clostridium difficile Nouveau né 2 mois) : Campylobacter, C. perfringens Recherche de C. difficile si antibiothérapie Recherche particulière : V. [...]
[...] cholerae, Amibes Repas contaminant TIAC SHU E. coli O157 Phase analytique : Aspect macroscopique des selles : Consistance : selles moulées / molles / liquides Aspect : purulent, sang, mucus Examen microscopique : coloration de Gram Présence de leucocytes et hématies germes invasifs Absence de leucocytes et hématies germes entérotoxinogènes Ensemencement des milieux de culture : milieux sélectifs , 37°C Identification Antibiogramme : pas systématique , intérêts : intensité et la durée de la diarrhée , limiter la contagiosité des selles , le risque de diffusion extra-intestinale Phase post-analytique : Édition et transmission des résultats au clinicien Interprétation : présence de Salmonella spp., Campylobacter spp., Yersinia enterocolitica, Shigella spp. [...]
[...] coli entéro-pathogène (EPEC), C. difficile Enterocolite plutôt dysentérique = Campylobacter , Salmonelles (mineures) STEC = E. coli entéro-hémorragique (EHEC) producteur de Shiga-toxines Clinique : colites hémorragiques Complications : SHU Différents sérotypes : O157 : H7 Réservoir : tube digestif des bovins Diagnostic : coproculture ou PCR , sérologie TIAC (Toxi-Infection Alimentaire d'origine Collective) 2 types de TIAC : Incubation courte : toxine ingérée S. aureus, Bacillus cereus Incubation longue (12-76h) : bactérie ingérée Salmonella spp., Y.enterocolitica, Campylobacter spp., Vibrio parahaemolyticus, Clostridium perfringens Les germes les plus fréquemment isolés en France : Salmonella , S. [...]
[...] déclaration à l'ARSTIAC Recherches spécifiques sur selles : demande explicite par prescripteurR Vibrio cholerae (et parahaemolyticus) E.coli EHEC : en pratique, PCR Clostridium difficile : Diarrhée aiguë survenue au cours ou au décours mois) d'une antibiothérapie si : Persiste > 48h après arrêt antibiothérapie Arrêt antibiothérapie pas envisageable Diarrhée sévère (AEG, fièvre . ) Terrain fragile : personnes âgées, ID, IR . Recherche toxines et mise en culture : toxine A+B de préférence , Test Immunocard Méridian Test ELISA : plus sensible mais moins rapide Test par PCR : résultat rapide en 1 heure Recherche spécifique de BMR : les BMR recherchées dans les selles de sujet à risque de BMR (réanimation, onco hématologie . [...]
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