Les méthodes de diagnostic bactériologique

Résumé du document

La démarche diagnostique au laboratoire de bactériologie repose sur un partenariat entre les médecins cliniciens et les bactériologistes et techniciens de laboratoire.
L'objectif de cette démarche est de trouver le pathogène responsable de la pathologie de notre patient. Une fois le pathogène identifié, il faut connaître sa sensibilité aux antibiotiques. Comme il n'y a plus beaucoup de nouveaux antibiotiques, il faut préserver l'efficacité de ceux qui existent.

Extraits

[...] Ces centres sont spécialisés dans une bactérie en particulier. Les laboratoires leur fournissent les souches obtenues par la mise en culture pour qu'ils puissent leur donner le nombre de cas en France ou l'épidémiologie de la résistance de la bactérie concernée. Rechercher d'antigènes bactériens : diagnostic très rapide Techniques de biologie moléculaire : méthodes d'amplification génique (PCR) II) Démarche pré-analytique Il faut se poser plusieurs questions : Est-ce que le site qu'on a prélevé est un site stérile ? Si il y a une flore, laquelle est-ce ? [...]

[...] Le prélèvement : Le bon de prélèvement : 1 prélèvement = 1 bon = des renseignements cliniques ! Le nom de celui qui demande le prélèvement Le numéro de téléphone auquel on peut le joindre L'heure du prélèvement La nature du prélèvement Les renseignements cliniques Le site La localisation et la latéralité Le mode de prélèvement Connaître les modalités de transport et le délai le plus vite possible, pour que l'analyse soit faite dans les meilleures conditions 3 parties du bon de bactériologie : Une partie pour la nature du prélèvement Une partie pour le mode de prélèvement Une partie pour les renseignements cliniques partie la plus importante car elle permet souvent de faire le diagnostic Les différents prélèvements : flacons d'hémoculture, pots stériles (pus, LCR), tubes (urines, sang, selles), écouvillons (différents en fonction du pathogène) Le transport : Délai d'acheminement : Le prélèvement doit être acheminé le plus vite possible au labo. [...]

[...] Il y a deux manières pour réaliser la cytologie : Cytologie manuelle : on étudie 1 mm3 de liquide biologique. Le liquide biologique est déposé sur un quadrillage, puis on le laisse se reposer. Ensuite, on l'étudie sous microscope. Par exemple, c'est la méthode utilisée pour l'étude su LCR la nuit car on a très peu de liquide, donc on ne peut pas le faire passer dans un automate Cytologie automatisée : marche très très bien pour les urines et est maintenant aussi utilisée pour les liquides d'ascite. [...]

[...] Les flacons sont insérés dans des alvéoles mobiles et incubés à 37°C favorise la croissance bactérienne. Il y a une détection des bactéries qui est faite en continu toutes les 10 minutes un ordinateur mesure la différence de potentiel au sein des flacons. Quand il y a un delta dans le flacon, le flacon est déclaré positif et c'est seulement à ce moment là qu'on réalise un examen direct Tests d'orientation : il existe 2 types de tests d'orientation Profil biochimique ou enzymatique : qu'est-ce que métabolise la bactérie ? [...]

[...] On met un peu de sang du patient qui a été détecté positif sur la lame pour étudier la mobilité de la bactérie. Bactérie péritriche, polaire, lophotriche Ceci permet d'orienter le diagnostic : par exemple, le Pseudomonas aeruginosa est très rapide alors qu'un Coli sera plus lent ces éléments sont utilisés par les bactériologistes pour orienter leur diagnostic mais ne sont pas détaillés aux cliniciens Coloration de Gram : Gram + : leur membrane externe porte un pepitdoglycanne très épais, de 40 ou 50 couches violet Gram - : leur membrane porte un peptidoglycanne beaucoup plus fin, de seulement 4 ou 5 couches et le LPS (lipopolysaccharide) rose Aspect : Aspect en chaînette : streptocoque Coccis en amas : staphylocoque Gros bacilles : lactobacilles Cocci dans les polynucléaires : méningocoque Spirochètes (bactéries très longues, spiralées) : treponema pallidum Vibrions vibrio, campylobacter Palissade listeria Sur un examen direct, le seuil de détection de l'oeil humain est de bactéries/mL. [...]