Traitement et analyse d'images : étude d'images échographiques de contraste

Résumé du document

Sujet de recherche concernant des images échographiques de contraste du foie. Le but est d'améliorer la lisibilité de ces images en leur appliquant différents traitements, filtres, avec le logiciel ImageJ.

Extraits

[...] Cependant on peut y voir nettement le déplacement du foie et l'évolution des contours. Le début et la fin (peu ou pas de présence de produit de contraste) sont particulièrement flous. Opération AND entre 2 images traitées avec le plug-in: L'outil image calculator peut ensuite réaliser l'opération AND entre 2 images prétraitées par anisotropicDiffusion puis Find Edge. AND On met ainsi en évidence les points communs entres les images et on obtient des contours relativement nets et précis. Modification de la LUT d'une image traitée par le plug-in : Nous avons ensuite décidé de re-tester le changement de LUT nommé edges : Image AnisotropicDiffusion Edges Le résultat est le suivant : On visionne très bien le contour du foie quoique très irrégulier Binarisation: On a retenté l'opération de binarisation déjà testée sur une image prétraitée à la main : Ici seuls les contours principaux restent visibles. [...]

[...] L'anisotropie : définition III. Utilisation de ImageJ 1. Décomposition des séquences vidéos en images 2. Avant l'installation du plug-in demandé a. b. Travail sur des images en RGB Travail sur des images en niveaux de gris 32 bits 3. Après l'installation du plug-in demandé a. b. c. [...]

[...] Les prétraitements effectués seront spécifiés dans le tableau sous les images concernées. Sans plug-in (traitements à la main) Avec prétraitement du plug-in prétraitements : despeckle prétraitements : plug-in Find edges Binarisation Find Edges prétraitements : augmentation du contraste Spectrum AND prétraitements : Find Edges Unsharp Mask gem Edges prétraitements : plug-in bien sur find edges Les différents filtres (médian, gaussien, minimum, maximum ) ont été testés rapidement mais n'ont pas été exposé ici car ils floutaient les images et ne permettaient aucun prétraitement intéressant concernant les tests que nous avons effectués Ce tableau comparatif montre bien la supériorité du prétraitement du plug-in : dans tous les cas, le meilleur résultat est obtenu grâce au prétraitement du plug-in. [...]

[...] Travail sur les images en RGB Ajustement de la luminosité et du contraste Nous avons tout d'abord tenté d'effectuer des réglages de luminosité : Cette première opération nous a ainsi permis de déterminer avec plus de précision l'emplacement du foie, car il faut le reconnaître, nous ne savions absolument pas où il se trouvait sur l'image avant traitement. Ici on peut démarquer ses contours via les taches claires. Suppression du bruit Le bruit de nos images est appelé Speckle or ImageJ dispose d'un outil nommé despeckle. Nous avons donc tenté d'appliquer successivement cet outil afin d'éliminer le bruit. [...]

[...] Ensuite il faut appliquer quelques traitements pour voir quelle est le type d'images (des images Ultrasonores de contrastes) et tester des outils de segmentation d'ImageJ. Puis installer le plug-in suivant : http://rsb.info.nih.gov/ij/plugins/anisotropic-diffusion.html Afin de tester les mêmes algorithmes de segmentation pour voir la différence avant et après le plug-in sur la diffusion anisotrope. II. Première approche du projet : mise en place d'une base de connaissances Après avoir eu confirmation du sujet choisi, nous avons d'abord effectué quelques recherches internet concernant le foie humain afin de connaître sa forme, sa taille, etc. [...]