Simulation de l'évolution de population

Thèmes abordés

évolution de populations, pressions évolutives, dérive génétique, sélection naturelle, régime de reproduction des individus, fréquences alléliques

Résumé du document

Lors de ce TP, nous avons réalisé différentes simulations de l'évolution de population afin de montrer l'effet de plusieurs pressions évolutives: la dérive génétique (le sort d'un allèle est seulement lié au hasard) dont nous identifierons les facteurs l'influençant, et la sélection naturelle (avantage d'un allèle par rapport à un autre, dans son environnement, qui permet de sélectionner un allèle, et donc un type d'individus), ainsi que l'effet du régime de reproduction sur l'évolution de populations. Pour réaliser ces différentes simulations, nous nous sommes servi de deux logiciels qui sont Redlynx et Drift.

Extraits

[...] Le second graphique représente le maximum de ʌp en fonction de la taille de la populations. Nous pouvons observer que ce maximum est le plus important lorsque nous avons une population de petite taille. Nous pouvons donc en déduire qu'il faut un nombre d'individus restreint dans une population afin que le maximum de ʌp soit important. Ces deux graphiques nous permettent d'étudier la dérive génétique et plus particulièrement, l'effet de la taille de la population considérée sur celle-ci. En effet, plus le nombre d'individus de cette population est faible et la fréquence initiale d'un allèle est importante, plus le maximum de ʌp est important et donc plus l'allèle se fixe rapidement . [...]

[...] L'évolution de la fréquence en fonction du temps de fixation est plutôt positive, c'est à dire plus la fréquence est élever plus le temps de fixation l'est également. 3/6 Compte rendu Tp pop Monfret Océane Graphique0,600 la fréquence initaile en fonction de la probabilité de fixation de l'allèle A de 0,500 p Linéaire probabilité de fixation Dans ce graphique on remarque que la probabilité de fixation de l'allèle A est inversement proportionnelle à la fréquence alllèlique. En effet, lorsque la fréquence allèlique est faible on constate que la fixation de A est plus importante et proche de 1. [...]

[...] On peut conclure à partir de ces observations que lorsque la fréquence allélique est élevé l'allèle se fixe plus difficilement. Ces deux graphique nous permet de dire que lorsque la fréquence allèlique est important, le temps de fixation est très important ainsi la probabilité de fixation de ce même allèle est très faible. A partir de l'étude de ces graphiques ont peut dire que la fréquence allèlique joue un rôle important dans la fixation d'un allèle. Etude du mode de reproduction La panmixie modifie les fréquences génotypiques mais pas les fréquences allèliques. [...]

[...] Cela ne s'applique pas pour tous les réplicats. S=0 Temps de fixation 600 (générations) Nombre de 1 réplicats fixé Effet de la sélection 4/6 Compte rendu Tp pop Monfret Océane En premier lieu, nous nous plaçons en condition de faible dérive; c'est à dire que nous choisissons une grande taille de population. Nous pouvons envisager plusieurs situations. Par exemple, nous nous plaçons dans une situation où la valeur sélective des deux génotypes des homozygotes est supérieure à celle des génotypes des hétérozygotes. [...]

[...] En effet, plus le nombre d'individus de la population est important, plus la dérive génétique est présente dans cette population. Logiciel Drift: Simulation de l'évolution d'une petite population Etude de la dérive et mise en évidence de l'effet de la taille de la population et de la fréquence initiale Nous utilisons le graphique afin d'avoir une vue d'ensemble des variations génétiques, et le tableau pour d'obtenir des valeurs précises de et d'identifier la fixation . Effet de la taille de la population: variation de N Il faut faire attention au temps de fixation. [...]