La transcription en détail

Résumé du document

Dans ce cours vous verrez le détail de la transcription. Cette étape qui permet au code génétique de s'exprimer, pour, par la suite, créer une protéine qui s'exprimera dans notre phénotype.

Extraits

[...] Ensuite, la sonde est dénaturée, puis incubation de la cible et de la sonde. Il y aura une hybridation par complémentarité de séquence Technique très utilisé pour proposer un diagnostic sur une leucémie myéloïde chronique où l'on peut détecter une anomalie chromosomique. Translocation équilibrée entre le K9 et le K22, le K22 remanié qui en résulte s'appelle K Philadelphie, on a donc une protéine de fusion BCR-ABL à forte expression d'ABL oncogène des patients auront un marqueur au K Philadelphie. [...]

[...] Cette coupure va aider à la terminaison de la transcription qui génère deux fragments d'ARN. Un fragment court qui sera rapidement dégradé, et un fragment d'ARN possédant une coiffe en 5'. Le recrutement de la poly(A) polymérase (PAP) permet à celle-ci d'être positionnée idéalement pour reconnaître l'extrémité 3' de cet ARN. Elle va alors allonger cette extrémité en y ajoutant de l'AMP résultant du clivage de l'ATP et la queue poly(A) résultante sera stabilisée par une protéine s'y fixant : la PAB (poly(A) binding protein) - Troisième évènement de maturation : l'étape du splicing Les introns correspondent à une séquence nucléotidique présente dans un gène et éliminé par épissage au niveau de l'ARN pour générer un ARN mature. [...]

[...] è C'est grâce à cette méthode que l'on peut déterminé si une séquence est une séquence consensus ou non. Région transcrite Cette région sera transcrite par la RNA polymérase une fois qu'elle sera recrutée au niveau du promoteur. Région de taille variable, dépend de la longueur des gènes et dépend des régions qui déterminent les stops de transcription qui sera également transcrit. La région transcrite commence au point d'initiation de la transcription souvent une base purique ou G). Ce ne coïncide jamais avec le point d'initiation de la traduction, ATG. [...]

[...] On suit l'expression du gène rapporteur. Au début on est dans une séquence d'ADN qui contient tous les éléments habituels : on observe le maximum de transcription. On commence à faire des délétions du côté 5' et on regarde ce qui se passe et quel est l'impact sur l'activité du gène rapporteur. Si on touche l'élément BRE, on a une chute de 40% de la production de la luciférase, cela veut dire que la transcription s'est moins bien passée et donc la traduction va donner moins d'enzyme. [...]

[...] Servent de séquences pour les répresseurs ou les activateurs des protéines La transcription Les séquences proximales peuvent avoir : - Un effet activateur (UAS = upstream activating sequence) Un effet répresseur (URS = upstream repressing sequence) Elles peuvent se présentés en plusieurs exemplaires GC-box (200 pb) fonctionne de manière orientation dépendante. Elle augmente l'efficacité de la transcription et on trouve cette séquence activatrice dans les promoteurs des gènes domestiques. CAT-box en amont du promoteur (100 c'est un signe de promoteur fort. [...]