La structure de l'ADN

Résumé du document

L'ADN est composé de desoxyribonucléotides dont 4 majeurs : dAMP ; dGMP ; dTMP ; dCMP et quelques mineurs (ex : 5methylcytosine).

Elle décrit un enchaînement de desoxyribonucleotides d'un brin d'ADN, relié par une liaison covalente.
La liaison s'effectue entre le phosphate porté par le carbone en position 5 d'un nucléotide et la fonction OH portée par le carbone en position 3 du nucléotide suivant. C'est donc une liaison phosphodiester.

Extraits

[...] - surenroulement positif = superhélice gauche On compacte la molécule d'ADN en augmentant le nombre d'enlacement - surenroulement négatif = desenroulement = superhélice droite On desenroule la double hélice en diminuant le nombre d'enlacements Dans les 2 cas il y a introduction d'une contrainte mais les super enroulements négatifs sont les plus abondants car ils rendent l'information génétique plus accessible. Ces super enroulements sont possibles grâce à des enzymes = topoisomerases - topoisomerase 2 Elle introduit des super enroulements négatifs. L'introduction de cette contrainte consomme de l'énergie sous forme d'ATP - topoisomerase 1 Elle supprime les super enroulements négatifs (supprime les contraintes). Cela se fait sans consommation d'ATP Bibliographie indicative La Double hélice ou Comment fut découverte la structure de l'ADN : Ethe Double helixe. [...]

[...] Le brin d'ADN est alors orienté : extrémité 5' phosphorylée et extrémité 3' OH libre. Par convention la lecture se fait dans le sens 5' vers 3'. Cela permet de définir la séquence du brin Structure secondaire Elle est constituée de 2 brins d'ADN présentant les mêmes caractéristiques et orientés de façon antiparallèle Les squelettes des 2 brins sont rejetés vers l'extérieur de la molécule et les bases azotées se situent au centre où elles forment des liaisons entre elles. [...]

[...] Ce sont les structures les plus importantes car ce sont des domaines fonctionnels (c'est à ce niveau que les bases azotées seront accessibles). Pour chacune des bases, certains atomes sont très bien exposés et pourront être reconnus par certaines protéines (cela permet notamment la lecture de l'information génétique). L'appariement des bases se fait par complémentarité. Elles sont liées par liaison hydrogène établie à très courte distance l'une de l'autre. Cette liaison implique un groupement donneur (Adénosine ou Guanine) et un groupement accepteur (Tyrosine ou Cytosine) de liaison H. [...]

[...] - forme A Elle est visible quand la molécule se trouve dans un environnement appauvri en eau. Elle est donc partiellement déshydratée et se replie sur elle-même. Diamètre = 2.6 nm Pas = 2.53 nm - forme Z Le squelette se trouve en forme de zigzag, l'hélice devient gauche. Cette contrainte est due à une séquence spécifique GCGCGC . Locale Structure tertiaire Le but est d'imposer à la molécule d'ADN des contraintes pour qu'elle se replie et prenne le moins de place possible. [...]