Le monde des ARNs

Résumé du document

Il s'agit d'une fiche de révision sur le monde des ARNs.

Le génome est une machinerie incroyable dont notre corps est constitué. Le génome est l'ensemble des gènes qui définissent notre génotype et par la suite notre phénotype. Prenons l'exemple de la couleur des yeux. Qu'est-ce qui définit la couleur de nos yeux, qu'ils soient marrons, bleus, verts ou autre ? Qu'est-ce qui définit leur forme ? Qu'est-ce qui fait que certaines personnes aux yeux bleus puissent avoir des petites tintes de jaunes ? Et bien, tout ça est déterminé par l'action de nos gènes contenu dans notre ADN. Dans ce cours vous verrez l'étape d'expression du code génétique appelé la transcription.

Extraits

[...] Pour des raisons pratiques, le RNA peut être converti en ADNc. On dépose des nanolitre d'ADN sur la plaque grâce à la miniaturisation des techniques de dépôt è Mesure simultané dans un échantillon biologique les espèces d'ARNm et leurs quantités respectives è Méthode globale : 1000 à 40000 gènes étudiés simultanément L'ARN dans la cellule Le monde des ARNs Si on fait une analyse de la population totale des RNA dans une cellule, on pensait qu'il y avait d'ARN codant et 96% d'ARN fonctionnel. [...]

[...] Etape d'exportation des messagers vers le cytoplasme. Plusieurs devenirs pour l'ARN : - Dégradation de l'ARN si instable à processus hautement contrôlé Traduction grâce au complexe d'initiation de la traduction en amont du RNAm, cependant la protéine n'aura pas encore sa conformation native au moment où elle est produite. Puis maturation de la protéine et possibilité de la protéolyse d'une partie de la protéine à protéine active A chaque instant de la transcription/traduction, présence des points de contrôle qui vont pouvoir contrôler le bon déroulement des différentes étapes et il pourra y avoir des voies alternatives à la traduction à il y aura une multitude de transcrits différents. [...]

[...] En vrai, uniquement d'ARN codant sont présents dans toute la population d'ARN et 98% d'ARN fonctionnel. - hnRNA : taille hétérogène d'ARN (précurseur du mRNA) snRNA : fonction catalytique, ils effectuent l'épissage snoRNA : localisé dans le nucléole et son impliqué dans les modifications post-transcriptionnelles des RNA ribosomaux siRNA : petit RNA interférent Les RNA non codants ne seront jamais traduits en protéine, ils feront leur fonction sous l'état d'ARN à rRNA et tRNA, ce sont les plus abondants dans une cellule Rôle des ARN : - ARN codant : protéines ARN non codants : structural (ARNr), catalytique (snRNA, ARNr), adaptateur (tRNA), régulateur (snoRNA qui interviennent dans plusieurs état pré et post-traductionnelle) Tous ces RNA sont produits à partir de la transcription grâce à des enzymes RNA pol différentes chez les eucaryotes), on aura deux grands produits : - RNA ribosomique et de transfert à les plus abondants et stables RNA messagers et régulateurs ncRNA à minoritaires et instables Un gène est un segment d'ADN codant pour une protéine (par l'intermédiaire d'un ARNm mature), un ARNt, un ARNr, un ARN régulateur. [...]

[...] L'expression des gènes est essentiellement régulée au niveau de la transcription 2. Contrôle des processus de maturation de RNA : représenté par l'étape de maturation et le slicing à excision des introns et assemblage des exons pour former le RNAm 3. Transport du RNA et sa localisation (peut être divisé en deux sous-étapes) : a Le transport : intermédiaire. Ce transport est actif, RNA est enveloppé de protéines protectrices qui vont dépliées le RNA pour passer les pores de l'enveloppe nucléaire. Dépense de l'énergie sous forme d'ATP. b. [...]

[...] Existence de plusieurs régulations Contrôle de la traduction : l'initiation peut être bloquée Dégradation de la protéine Contrôle de l'activation de la protéine en attente de changements post-traductionnelle pour la rendre fonctionnelle DNA microarrays (Puces à ADN) Approche la plus connue pour étudier le transcriptome But : mesurer le niveau d'expression d'un gène : Est-il actif ou inactif dans une condition particulière biologique ? Cet état est-il différent entre deux conditions biologiques ? Principe : dans chaque spot, est déposé des microquantités d'un type d'ADN d'un gène différent. Ces ADN sont fixés en rangée ordonnée (dans des positions déterminées). [...]