Du génotype au phénotype - publié le 03/04/2022

Résumé du document

Dans ce cours, vous verrez différents types d'interaction :
- interactions entre allèle d'un même gène (caractérisation des allèles, haploinsuffisance, exemple du gène CFTR dnas la mucoviscidose, exemple du syndrome de Marfan, exemple de la pigmentation des yeux de la drosophile)
- interactions entre gènes (différents types d'interaction, création d'un nouveau phénotype, aggravation ou suppression d'un phénotype mutant, les différents types de mutation à effet suppresseur, les méthodes permettant de mettre en évidence les interactions entre gènes
- interactions gènes/environnement (épigénétique, structure de la chromatine, du nucléosome)
- caractère quantitatifs et génétique multifactorielle

Extraits

[...] Deux plasmides qui sont introduit dans une même levure : Un contenant protéine Z et le domaine d'activation de GAL 4 Un contenant la protéine X et le domaine DB de GAL4 Si les deux protéines n'interagissent pas ensemble (si X et Z n'interagissent pas ensemble) ; GAL 4 ne sera pas fonctionnel Si la protéine X et Y interagissent ensemble, rapprochement du domaine de transcription du domaine de fixation à reconstitution du FT de Gal 4 Comment visualiser si GAL4 est fonctionnel ou non ? On utilise un gène rapporteur donc la levure est transgénique. Lac Z est un gène bactérien qui code pour une enzyme appelée la β-galactosidase qui est impliquée dans la dégradation du lactose en glucose. Lac Z fait partie des trois gènes de l'opéron lactose. [...]

[...] Les modifications post-traductionnelles se font lorsque les histones sont déjà positionnés sur la chromatine. Les protéines « writer » vont marquer les histones, les protéines « eraser » peuvent enlever les méthylation sur les histones. Méthylation de l'ADN et contrôle de la transcription Il peut y avoir des cytosines qui peuvent être méthylées, ces cytosines sont présentes au niveau des promoteurs sont sous forme de dinucléotides CG, c'est ce que l'on appelle des ilôts de CG (CpG). Ces régions peuvent être méthylée par une DNA méthyltransférase, ce qui bloquera la transcription en empêchant l'accès à l'ARN polymérase. [...]

[...] o Suppression : apparition d'une deuxième mutation dans le gène Su qui va supprimer le phénotype lié à la mutation. Qui peut être dû à trois choses : § Suppression intragénique : la mutation Su1 se produit également dans le gène il y aura une deuxième mutation dans le même gène, peut supprimer l'effet de la première. Permet d'identifier les relations structures/ fonctions des différents résidus au sein d'une autre protéine/d'un même gène § Suppression extragénique : la mutation Su1 est dans un gène différent de a. [...]

[...] Par des méthodes moléculaires, on utilise des marqueurs génétiques pour faire de la cartographie génétique. Les modèles animaux peuvent donc être utilisés pour identifier des QTL qui sont présents chez les hommes. [...]

[...] C'est un bon gène rapporteur car on utilise un substrat artificiel de la β-galactosidase appelé le X-gal. Lorsque ce produit est dégradé par la β-galactosidase, il donne un produit bleu. Les levures sont transgénique et contient le gène rapporteur LacZ sous contrôle d'un promoteur minimal, devant lequel il y a les séquences UAS. Si les deux protéines interagissent à GAL 4 fonctionnel à protéine de fusion se fixe sur GAL4 UAS à transcription du gène rapporteur. Contrôle pour vérifier que c'est bien blanc : GAL4DB-X et GAL4AD à pas d'expression du rapporteur, on peut donc exploiter les résultats. [...]