Génome, transcriptome, protéome

Thèmes abordés

Génome, transcriptome, protéome, ADN, ARN, génétique

Résumé du document

Les biomarqueurs font partie des pratiques médicales depuis de nombreuses années, leur développement s'est accéléré dans la dernière décennie suite à lévolu†ion technologique des pratiques de diagnostic utilisés en routine.
Biomarqueur utilisé dans différentes spécialités (diabètes, anesthésie, cancérologie....)

Ces biomarqueurs sont trouvables au niveau des 3 système biologiques :
– ADN
– ARN
– protéine

Extraits

[...] Chez l'homme le génome code pour environ gènes. Ces gènes peuvent subir des épissages alternatifs. On se retrouve avec > ARNm. Qui eux peuvent donner > protéines. Génome : études gene transcriptome : étude des messager protéome :é tudes des protéines II) Le génome : Généralités L'ADN = molécule linéaire formée de quatre nucléotides = base azoté (adénine, cytosine, guanine, thymidine) + sucre (désoxyribose) + phosphate. Le génome humaine mesure environs 3300 Mégapb et porte plus de gènes répartis entre : génome nucléaire (23 paires de chromosomes) génome mitochondriale Les cellules d'un même organisme (10^13 cellules), à l'exception des GR (anuclées) et des gamètes (haploïde) possèdent le même génome. [...]

[...] Exemple du CD44 : récepteur à l'acide hyaluronique Ce récepteur est codé par une 20aine d'exons. Certaines isoformes sont appliquées dans certaines pathologies. Les micro-ARN Petit ARN (19-25pb). Se fixe de facon complémentaire sur des ARN messagers micro ARN reconnaît 200 ARN messagers. Ces ARN messager deviennent double brins ils sont alors dégrader et ne seront pas traduit. Les micro ARN = signal de diminution des messagers. Leur expression est elle même régulée, en particulier par la méthylation et l'acétylation et peut être amplifiée ou diminuée au cours des processus de cancérisation. [...]

[...] Codon en cause est ponctuel en position 132, CAT au lieu de CGT par exemple) Cancer bronchique : mutation de l'EGFR dans les cancers bronchiques à petites cellules prédisent la réponse des patients atteints de cancer bronchiques à l'erlotinib. La mutation est ici une mutation activatrice. Pas besoin de ligand pour que le récepteur soit actif. L'erlotinib antagoniste du récepteur. III) Transcriptome Généralités = Profil d'expression des ARNs messagers. Régulations épigénétiques L'ensemble des modifications transmissibles d'une génération à l'autre et réversibles de l'expression génique sans altération des séquences nucléotidiques. [...]

[...] L'enzyme AHH et cancer bronchique activité AHH contrôle le métabolisme des Acide aminé mais aussi du benzopyrène principal agent carcinogène du tabac AHH transforme le benzopyrène en diol-epoxyde dangereux que le benzopyrène. les sujet ayant une AHH élevée ont un risque accru de cancer bronchique. Comment choisir le biomarqueur : Pour bien choisir le biomarqueur 4 éléments sont pris en compte : quel est le paramètre mesuré l'aire thérapeutique ciblée technologie de support niveau de complexité. Aujourd'hui on pratique souvent par un système de stratification. [...]

[...] Les parties non codantes sont des séquences hautement ou moyennement répétées dans le tout génome : séquence répétées dispersées (=répétition de séquences apparentés sur l'ensemble du génome) LINE : 17% du génome. 6-8kb SINE : 11% du génome. 100-400kb rétroposons transposon séquences répétées en tandem (=répétition d'une suite de qqs nucléotides adjacents) microsatellites : séquence courte à 13pb). Polymorphe (très différents d'un individu à l'autre signe l'individu). Séquence retrouvé sur toute la hauteur des bras (répartis sur l'ensemble du chromosome) cartographie du chromosome. minisatellites : séquence plus longue (14 à 500pb). Peu polymorphe. [...]