Fiche de révision de tout le programme de microbio de L2

Résumé du document

Fiche de tout le programme de micro biologie : Chapitre I introduction à la microbiologie - Chapitre II les cellules procaryotes: structure et fonction - Chapitre III Nutrition et croissance bactérienne - Chapitre IV: Les associations et relations entre organismes: relation microorganisme – hôte - Chapitre V La chimiothérapie antimicrobienne

Extraits

[...] Besoins spécifiques facteurs de croissance Certaines bactéries ont besoin de substance organiques qu'ils ne peuvent pas synthétiser = Facteur de croissance classes différentes Acides aminés : 20-25 mg/L Bases puridiques et purimidiques (ATCG) : 10mg/L Vitamines : 20-25 micro/ L Autres besoins organiques o Sucres, protéines, lipides,  Capables de fabriquer = prototrophes  Incapables de fabriquer = auxotrophes mais présents dans le milieu ou produit par autre espèce = Syntrophie Partie croissance bacterienne I. Definition de la croissance bacterienne II. [...]

[...] Méthode de dilution o Culture bactérienne avec concentration croissante en antibiotique o Solution trouble = signe d'une multiplication cellulaire o Absence de solution trouble = absence de multiplication cellulaire = bactérie inhibée o Croissance inhibée ou morte ? Prélèvement du contenu puis transfert dans une fiole sans antibiotique Trouble= alors bactérie avait juste sa croissance inhibée car son activité a repris Claire= alors elle est morte Dilution en gélose o Boite de pétri + appareil de steers o Disque avec chacun concentration différente en antibiotique o On va observer tapis bactériens = croissance o Graphique diamètre inhibé en fonction de la concentration en antibiotique Souche sensible : CMI 2 microg/mL D [...]

[...] Production d'énergie Différent des cellules eucaryotes car absence de stérol (cholestérol) Mais stérol particulier = hopanoïde Stabilisent membrane Mosaïque fluide : Protéines intrinsèques et extrinsèques peuvent glisser le long de la membrane = 20-30% protéines membranaires Système membranaire interne o Mésosome o Plis membranaires Rôle dans la respiration et autres processus bactériens Cytochromes + chlorophylles Ribosome et corps d'inclusions o Sacs membranaires o 2 membranes avec réserves organiques Toutes les bactéries ont une seule réserve sauf les photosynthétiques Réserves inorganiques Constituées de précipités de sels (polyphosphates ou souffre élémentaire) Pas entourés d'une membrane Nucleoïde et chromosome bactérien o Système membranaire qui fixe K bactérien Rôle dans la R et division cellulaire Adn double brin circulaire et pas de membrane Plasmides o o o =petite molécule d'ADN circulaire différente du K , peut porter gène d'avantage sélectif , pas indispensable à la vie d'une bactérie sauf quand résistance Structure Ori autonome) + gène de sélection (repérable par organisme au fil des multiplications) Chez pro et eucaryotes Fonction Morceau d'ADN transfert horizontal de c en c Gène d'intérêt =>casette de clonage Paroi de la cellule procaryote o o = exosquelette = protection + forme + Résistance Gram + Gram – Gram + Violette Acide lipoteichoiques ou teicoiques charge Espace périplasmique et peptidoglycane = 20-80 nm o GramRouge Paroi plus complexe Espace périplasmique et peptidoglycane = max 8 nm = moins de liaison interpeptidique Absence membrane externe Membrane externe en peptidoglycane Préparation pour déterminer si gram+ ou Gram –  Culture de bactérie  Lame microscope  Séchage et fixation (flambée : 1 goutte d'alcool + feu) Gram + GramCristal violet = Violet Violet fixateur Lugol = fixateur Violet Violet Ethanol = solvant Violet incolore Safranine= solvant Violet rouge Observation Violet rouge microscopique x1000 Le colorant est une Ethanol ne pourra L'éthanol va molécule petite et le pas atteindre le passer , se solvant molécule plus colorant car la solubiliser et grande molécule est trop permettre le grosse pour changement de passer , donc la couleur du violet bactérie va rester au rouge car violette safranine pourra s'y accrocher Les composants de la paroi : Capsule  Couche supplémentaire à l'extérieur de la paroi  Couche bien structurée  Peut être facilement enlevée  Protection contre phagocytose et dessiccation  Repousse virus bactérie et substance hydrophobe Couche mucoïde  Couche de substance diffuse (polysaccharidique) non organisée  Pas de rôle défini Glycocalyx  Réseau de polysaccharide  Recouvre la surface des bactéries et cellules voisines  Attachement de la bactérie aux surfaces solides Couche s  Retrouvée chez bcp de et et archéobactérie  = protéine et glycoprotéine  Protection variation ionique, pH, pression osmotique et enzyme Les pili et les fimbriae o o o Flagelle et mobilité o o o o o Filaments qui partent de la surface de certaines bactéries , levures) Pas de rôle mobilité mais adhésion cellules + virulence pathogène = pili en fonction de leur fonction Non sexuels impliqués dans adhésion et fixation support Sexuel impliqué dans phénotype de la conjugaison Filament locomoteur Nombre = taxonomie Monotriche = 1 f d'un coté Amphitriche = 2 f de chaque coté Lophotriche = 2 ou plusieurs f d'un coté Peritriche = plusieurs f (paires) repartis également autour de la bactérie Flagelle = base + crochet + filament (flageline) Fonctionne comme une hélice Tourne dans les sens des aiguilles d'une montre = recule = culbute Tourne dans le sens inverse des aiguilles d'une montre = avance = course Chimiotactisme = mouvement orienté vers substance attractive ou son contraire Gradient chimique chimiorecepteurs=> générateur de culbute culbute ou course La spore bactérienne o o = structure spécifique résistante, dormante, développée par à l'intérieur de la bactérie Résistance Aux conditions sévères (sècheresse déshydratation chaleur) Milieu hospitalier (résistance antibiotique, gel antibactérien) UV Dure à éliminer Intérêt : permet parfois le maintien d'un élément dans un milieu d'intérêt o Structure Exosporium :  Enveloppe mince fragile protection mais pas de résistance Tunique  Couche protéique  Résistance aux agents chimiques Cortex  Peptidoglycane  Résistance température  Car composé acide dipicolinique associé à ions Ca+  Rôle « éponge » : concentration de l'eau au bord du cortex et peu d'eau à l'intérieur si température n'augmente pas de destruction ADN à cause agitation d'eau Paroi de la spore  Nucleoïde : K bactériens  Ribosome  Sont tous deux indispensables à la protection de la paroi du cortex et de la tunique o Sporogenese ou sporulation o Bactérie germination, se multiplie, grandit Septum pour diviser la cellule Multiplication ADN s'allonge puis division cellulaire 2 structures différentes séparées par filament axial Adn protégé par 2 parois Enkystement, formation cortex : devient résistant à t° Synthèse tunique : devient résistant aux produits chimiques Structure devient résistante aux radiations 2e couche disparait : + petite donc – énergie De la spore à la cellule végétative Activation :  Processus réversible  Prépare à la deuxième étape  Déclenchée par choc thermique en général chauffage  Si variation t° + présence de nutriment étape 2  Sinon fin de l'activation Germination  Gonflement, éclatement tunique + cortex = bactérie  T° optimale de croissance  Retour mécanisme de synthèse des protéines Croissance  Accélération et augmentation bactérie avec taille initiale Chapitre III Nutrition et croissance bactérienne Partie Nutrition 1 nutriment doit : Fournir énergie pour augmenter la croissance cellulaire Fournir les matériaux nécessaires à la synthèse des constituants cellulaires Etre utilisable comme accepteur d'électron et de proton libérés au cours de la production d'énergie Chez l'homme : accepteur d'électron = oxygène I. Classification nutritionnelle des microorganismes selon les sources de carbone et d'électrons Chimioorganotrophes = majeure partie des microorganismes (anx , H ) Photolitotrophe = plantes II. [...]

[...] T° optimales = ce qu'il faut retenir A T°> T°max : bactéries ne se développe plus Adaptation aux fortes T° o o o La température Bactérie sous forte t° grande vibration moléculaire séparation 2 brins d'ADN (dénaturation) bactérie plus fragile peut mourir Forte agitation moléculaire, membrane peut éclater Si lipides, membrane peut fondre Bactéries Résistantes ADN plus riche en GC liaisons que celles qui ne sont pas R %Acides gras saturé dans, la membrane plus important Protéines de choc thermiques : forment tunnel qui protège protéines qui viennent d'être formées qu'a ce qu'elle deviennent tridimensionnelles Riches en ponts disulfures Bicouche lipidiques forme 1 couche(archéobactérie) + résistante Adaptation aux faibles T° o o o Ce qui tue la bactérie quand froid = transformation de l'eau en cristaux (augmentation masse) Fabrication molécule semblable à celle du glycérol = antigel Membrane riche en AG insaturés, prennent moins vite en masse o Enzyme es bactéries ont des optimum plus bas Application : Lessive efficace dès 20°c car enzyme extraits de bactéries résistantes aux basses températures Pareil pour résoudre problème cristallisation dans l'agriculture, bourgeon aspergé avec produits contenants même enzyme C. [...]

[...] Système de culture fermé = on met tout au début puis on enlève et ne rajoute rien Discontinu ou en batch Moculum = quantité de bactérie initiale B. Courbe de croissance Phase de croissance et signification Phase 1 = Latence Nombre de bactéries reste constant Phase d'adaptation des bactéries au milieu de culture (temps dépend de l'âge de la bactérie Phase 2 = Accroissement o Phase intermédiaire d'accélération o o Phase 3 = croissance exponentielle o V de croissance max + constante o Division des bactéries à intervalle de temps réguliers o Bactéries uniformes d'un pdv propriété chimie et physiologique Phase 4 = stationnaire o Nombre de bactéries ne varie plus o Nombre de Naissance = nombre de mort ou arrêt de l'activité de toutes les bactéries Phase 5 = déclin o o Milieu est devenu défavorable à cause des substrats limitants Bactéries éclatent et meurent C. [...]