La cytométrie en flux en biologie clinique

Résumé du document

Cytométrie en flux en biologie clinique
- Fonctionnement technique de la cytométrie en flux
- Différentes applications de la cytométrie en flux en clinique
- Bonus : utilisation de la spectrométrie de masse en clinique

Extraits

[...] Leur mécanisme intime est souvent mal connu. L'analyseur : pour mesurer m/z Il mesure les valeurs du rapport : masse / nb de charge (appelé m/z). C'est une partie de l'appareil où règne un vide suffisant pour que le libre parcours moyen des ions soit supérieur à la distance à parcourir dans l'appareil pour atteindre le détecteur. CECI IMPLIQUE : • Des champs électrostatiques très précis pour guider et déplacer les ions dans l'appareil (lentilles électrostatiques, optique ionique) • Un vide suffisant pour que les ions puissent se déplacer sans être détruits ou déviés par des molécules résiduelles (notion de libre parcours moyen) Applications : - Protéomique clinique : mise en évidence de biomarqueurs dans les fluides biologiques - Application en bactériologie pour la détermination des différentes souches - Etude d'anomalies protéiques (mutation, délétions), des modifications post-traductionnelles - Détermination de la concentration de drogues/métabolites dans les fluides biologiques. [...]

[...]  Le garant de l'intégrité physique c'est la protéine.  La protéomique est une technique complémentaire de la transcriptomique et de la génomique, permettant l'identification de nouveaux marqueurs. Un même génome peut donner naissance à beaucoup de protéome différents. Le niveau d'expression des protéines n'est pas prédictible à partir du niveau d'expression des ARNm. Les ARNm peuvent présenter une importante diversité (promoteurs et épissages différents). Les protéines peuvent être traduite à partir de différents codons d'initiation. Les protéines subissent des modifications post-traductionnelles. [...]

[...] On a une infection par une bactérie X qu'on ne connait pas. L'intérêt du clinicien est de Typer la bactérie pour connaitre son spectre de résistance antibiotique et pour choisir le bon traitement afin de combattre l'infection. On a notre membrane bactérienne avec différentes protéines ayant des masses spécifiques, je compare mon spectre obtenu avec une base de données. Si le pic de notre bactérie correspond à une bactérie déjà enregistrée, on connait la bactérie de notre patient et donc le traitement adapté. [...]

[...] En étudiant des cellules cancéreuses triées avec notre cytométrie en flux on peut analyser le protéome cancéreux pour ensuite le comparer à d'autres pathologies ou cellules saines. Le but est d'avoir l'état sain et pathologique pour avoir la prise en charge spécifique du patient. Médecine personnalisée : Elle consiste à traiter chaque patient de façon individualisée en fonction des spécificités génétiques et biologiques de sa tumeur mais également en tenant compte de l'environnement du patient, de son mode de vie  Adapter le médicament au mécanisme de la maladie  Prédire l'évolution de la maladie Il faut comprendre les mécanismes impliqués et les voies de signalisation touchées. [...]

[...] La cytométrie en flux La cytométrie en flux (CMF) est une technique qui permet de compter et caractériser des cellules en les faisant défiler à grande vitesse dans un faisceau lumineux. La caractérisation est basée sur l'étude de la lumière réémise (par diffusion ou fluorescence). Elle permet de caractériser de façon individuelle, quantitative et qualitative des cellules en suspension dans un liquide. Principe : faire passer des cellules les unes après les autres dans un flux devant un détecteur en analysant les caractéristiques de ces cellules : taille, structure, fluorescence. Définition : La cytométrie en flux permet l'étude précise de cellules isolées entrainées dans un flux 1 liquide. [...]