L'arbre phylogénétique est construit à partir d'une matrice des caractères établie par la comparaison de caractères qui peuvent être : morphologiques, anatomiques, embryologiques ou paléontologiques.
On ne peut comparer que des organes homologues. Des organes sont homologues s'ils présentent le même plan d'organisation, ont les mêmes relations au reste du corps et ont une même origine embryologique.
[...] - La notion de caractère dérivé est RELATIVE : elle est définie par rapport au groupe d'espèces dont on recherche les liens de parenté. Exemple: au sein des vertébrés, la possession d'un placenta est un caractère dérivé mais, au sein des Primates, c'est un caractère ancestral (car les TOUS les primates ont un placenta). Il ne peut donc servir pour établir des relations de parenté au sein des Primates. ! [...]
[...] Fiche méthodologique pour construire ou tirer des informations d'un arbre phylogénétique Fiche méthodologique pour construire ou tirer des informations d'un arbre phylogénétique. Il est construit à partir d'une matrice des caractères établie par la comparaison de caractères qui peuvent être : morphologiques, anatomiques, embryologiques ou paléontologiques On ne peut comparer que des organes homologues Des organes sont homologues s'ils présentent le même plan d'organisation, ont les mêmes relations au reste du corps et ont une même origine embryologique L'état d'un caractère qui résulte d'une innovation est dit dérivé Les relations de parenté sont établies en prenant uniquement en compte les états dérivés de caractères homologues Un arbre phylogénétique est construit sur le principe du partage des états dérivés des caractères - Deux espèces sont d'autant plus apparentées que leur nombre d'états dérivés partagé est élevé ou si elles partagent un ancêtre commun exclusif qu'elles ne partagent avec aucune autre espèce -Les ancêtres communs se trouvent toujours aux nœuds de l'arbre et sont hypothétiques. [...]
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