Epidémiologie moléculaire des Paramyxoviridae : Genres Respirovirus et Rubulavirus

Résumé du document

Le complexe d'ARN polymerase des genres Respirovirus et Rubulavirus, membres de la famille des Paramyxoviridae, est formé par une large protéine multifonctionnelle (protéine L, 255 kDa). De l'alignement multiple des séquences d'acides aminés et nucléotides, un groupe de segments de séquences hautement homologues ont été identifiés au sein du corps de la protéine L. Ici, nos nous sommes focalisés sur un domaine inclus entre les acides aminés 712 et 841 de la protéine L des Respirovirus et des Rubulavirus qui sont conservés. Nos résultats démontrent la présence d'une séquence homologue entre Respirovirus et Rubulavirus pour laquelle il est possible de déterminer des primers putatifs. Actuellement, une étude plus conséquente et la réalisation d'une banque de données sont en cours.

Extraits

[...] MOYER An amino-proximal domain of the L protein binds to the P protein in the measles virus RNA polymerase complex. Virology 205:540-545. KAWANO, M., OKAMOTO, K., BANDO, H., TSURUDOME, M., KOMADA, H. & ITO, Y Characterizations of the human parainfluenza type 2 virus gene encoding the L protein and the intergenic sequences. Nucleic Acids Research 19, 2739-2776 MALUR AG, CHOUDHARY SK, DE BP, BANERJEE AK Role of a highly conserved NH(2)-terminal domain of the human parainfluenza virus type 3 RNA polymerase. [...]

[...] La rougeole demeure une principale cause de la mortalité infantile, en dépit de la disponibilité d'un vaccin efficace depuis les 40 dernières années. Presque tous les enfants non-immunisés contractent la rougeole s'ils sont exposés au virus. C'est pour cela que l'on estime à personnes environ, la plupart d'entre elles étant des enfants, mortes de la rougeole en 2005. La rougeole est l'une des maladies les plus contagieuses connues, provoquée par un virus de la famille des Paramyxoviridae. La rougeole, autant par sa fréquence, sa propagation que par sa morbidité, se place ainsi comme l'un des problèmes majeurs de santé publique. [...]

[...] K., J. A. FELLER, and S. A. MOYER Mutations in domain V of the Sendai virus L polymerase protein uncouple transcription and replication and differentially affect replication in vitro and in vivo. Virology 277:387-396. DOWNHAM M.A., McQUILLIN J., GARDNER P.S Diagnosis and significance of parainfluenza virus infections in children Arch. Dis. Child : 8-15 FREYMUTH F Virus respiratoire syncytial, métapneumovirus et virus para-influenza humains : propriétés des virus, multiplication, épidémiologie. Traité de pédiatrie. [...]

[...] L'alignement des séquences a été réalisé, par CLUSTAL pour les isolats des protéines L des genres Respirovirus et Rubulavirus (fig. 2). Lors de l'alignement, le score minimum de similarité retenu fut de 85%. L'alignement démontre les relations entre toutes les séquences de la protéine révélant la présence de fortes régions conservées à proximité du NH2 terminal, entre les résidus d'acides aminés 13 et 25 par exemple, avec une séquence unique [IL(Y/L)PE(C/V)HL(N/D)SPIV] conservée dans de nombreuses protéines L de paramyxovirus (Malur et al., 2002). [...]

[...] Ce système de centralisation des données pourrait s'avérer à l'avenir un outil de diagnostic fiable et rapide de par la quantité et la qualité des informations qui y seraient disponibles tout en étant reliées entre elles. Références BANERJEE, A. K., S. BARIK, and B. P. DE Gene expression of nonsegmented negative strand RNA viruses. Pharmacol. Ther. 51:47-70. CORTESE, C. [...]