La régulation de l'expression des gènes chez les végétaux

Résumé du document

Un gène comporte une partie codante et une partie régulatrice. La partie régulatrice est constituée du promoteur en amont de la région codante comprise entre l'ATG et le codon STOP. Suite à la transcription l'ARNm présente également deux autres séquences régulatrices : 3' et 5' UTR. Les gènes ayant des fonctions proches portent souvent des éléments CIS similaires. Les éléments CIS peuvent être représentés plusieurs fois sur un promoteur. Quand ils sont très proches les uns des autres ils montrent des interactions avec des facteurs de transcription (...)

Extraits

[...] S'il n'y a pas de correspondance avec ces séquences, il n'y aura pas de fixation. R2 est un peu moins spécifique. Il augmente la fixation en interagissant avec des acides aminés en bordures de la séquence CIS reconnue par R3. Le type R1/2 est assez particulier et est très proche du facteurs hTRF1 qui se lie aux télomères chez les animaux. Ce facteur possède également une structure en hélice coude hélice mais la dernière hélice est beaucoup plus longue chez R1/2 et permet la dimérisation. [...]

[...] Donc ces FT ne sont pas régulés par d'autres facteurs. Il existe un mutant de ces FT : ttg2. Il présente plusieurs caractéristiques car ces FT agissent sur plusieurs gènes. TTG2 = transparent testa glabra 2. La graine est transparente ce qui indique que la mutation touche la pigmentation vacuolaire ( diminution des anthocyanes) et donc touche le métabolisme des métabolites secondaires. Glabra signifie sans pilosité c'est-à-dire sans trichomes ( cellules avec excroissances). Donc les FT WRKY agissent également sur la morphogenèse. [...]

[...] Autres techniques pour étudier les éléments TRANS : On peut isoler un petit morceau de promoteur radiomarqué et le mettre en présence de protéines nucléaires et faire une migration sur gel de polyacrylamide. Si il y a fixation, la migration sera plus lente quand son absence. Une autre méthode est la protection à la DNase. On marque aux extrémités, on met en contact avec des protéines nucléaires et on fait une digestion à la DNase. La partie non digérée est protégées par la protéine. [...]

[...] L'analyse du promoteur Wbox présente plusieurs séquences relativement courte ce qui permet de dire que les FT WRKY interagissent entre eux. La fixation de ces FT est dépendante d'un événement post traductionnel. Il faut que ces FT soient phosphorylés par une kinase pour être actif. En présence de phosphatase ou d'un inhibiteur de kinase comme la straurosporine ils sont inactifs. On peut empêcher l'interaction entre les FT WRKY par utilisation de molécules inhibant les interaction protéine- protéine comme le déoxycholate. [...]

[...] Cette zone possède des acides aminés chargés. En général, ce sont des activateurs. Exception chez le Maïs avec la protéine VP1 qui peut être activatrice ou inhibitrice. Il y a une distribution homogène de ces gènes de FT dans les cinq chromosomes de A. taliana. Mais ces gènes sont uniques ce qui est assez rare gènes ont été découverts et proviennent de l'évolution d'un ancêtre commun avec une seul boîte dupliquée ensuite. Ceci a été montré par la position des introns qui sont souvent présents au milieu des boîtes WRKY. [...]