Le rôle de l'informatique dans la conception des médicaments

Résumé du document

Ces dernières années, l'élaboration de nouvelles molécules d'intérêt thérapeutique a connu un formidable essor et continue sur sa lancée. Les avancées réalisées sont considérables.

Extraits

[...] Dans le présent travail, l'utilisation des outils bioinformatiques nous a permis d'établir un modèle tridimensionnel de la cible thérapeutique, l'enzyme tyrosine aminotransférase (TAT) du parasite Trypanosoma cruzi qui est responsable d'une maladie souvent fatale chez l'Homme (la maladie de Chagas). La protéine TAT est impliquée dans certaines voies métaboliques chez le parasite T. cruzi. Une analyse plus approfondie du modèle tridimensionnelle proposé de la protéine TAT de T. cruzi permettrait d'identifier des sites promoteurs ou ligand capables de se lier 'à la protéine et enfin de déterminer un inhibiteur de TAT dont le rôle est de diminuer l'activité de l'enzyme. [...]

[...] On cherche ensuite des séquences similaires dans des banques de données de protéines synthétisées par des organismes modèles. Les bandes vertes indiquent des zones de grande variabilité (les acides aminés sont peu conservés d'un organisme à un autre), et les bandes orange, des zones de faible variabilité. On modélise la protéine humaine à partir des substances des protéines similaires des organismes modèles et, enfin, on crée une molécule qui se fixe à la protéine modélisée. Le tableau 1 rapporte quelques exemples de cibles thérapeutiques identifiées. [...]

[...] L'enzyme TAT est une protéine clé dans un certain nombre de réactions métaboliques incluant la biosynthèse et la dégradation d'acides aminés aromatiques et le métabolisme carbohydraté. TATc de T cruzi est également impliquée dans la réoxydation de NADH cytosolique (Montemartini et al, 1994), dans la biosynthèse d'acide aminé aromatique et dans le recyclage de la méthionine, qui est un acide aminé essentiel impliqué dans plusieurs processus (Rego et al, 2007) Localisation de la Tyrosine aminotransférase TAT L'expression et l'activité se la protéine TAT a été identifié principalement dans le cytosol et à un niveau faible dans la mitochondrie chez la parasite T. [...]

[...] Ceci présente un intérêt évident pour l'industrie pharmaceutique d'une part à la connaissance des gènes associés au développement des maladies héréditaires et d'autre part dans le processus de la conception rationnelle de médicament. Une des étapes dans la conception rationnelle du médicament est la modélisation moléculaire. Il s'agit d'une approche aidant à la conception de molécules par l'utilisation de la visualisation tridimensionnelle des molécules et des protéines, la caractérisation des interactions entre un ligand et son récepteur et l'analyse des relations structure-fonction. [...]

[...] Les amastigotes se divisent par scissiparité et se métamorphosent en trypomastigotes, puis sont libérés dans la circulation comme trypomastigotes circulants. Ces trypomastigotes infectent des cellules d'un type particulier et se transforment en amastigotes intracellulaires, dans de nouveaux sites d'infection. Les amastigotes intracellulaires détruisent les neurones intra-muraux du système nerveux autonome de l'intestin et du cœur, ce qui conduit respectivement au mégacôlon et à l'anévrysme L'infection causée par Trypanosoma cruzi : la maladie de Chagas La maladie de Chagas est une forme de trypanosomiase décrite en 1909 par Carlos Chagas provoqué par Trypanosoma cruzi et transmise par des punaises hématophages des genres Triatoma et Rhodnius. [...]