Généralités sur l'enzymologie et les enzymes

Thèmes abordés

Sciences humaines et arts, enzymologie, enzymes, propriétés générales des enzymes, classification des enzymes, Site actif, catalyse, facteurs physicochimiques

Résumé du document

Catalyseurs biologiques protéiques : augmentent la vitesse en diminuant l'énergie
d'activation, sans modifier l'équilibre thermodynamique de la réaction.
Spécificité d'une enzyme vis-à-vis :
- De type de réaction catalysée.
- Spécificité pour le substrat.

Extraits

[...] Lésion du myocarde : apparition de MC. Utiliser comme : - Réactifs : Marquage d'Ac par la péroxydase ou la phosphatase alcaline. - Agents thérapeutiques : enzymes thérapeutiques Enzyme, activateur de prodrogue Lactase : intolérance au lactose. [...]

[...] Classification des enzymes EC : 4 chiffres. - 1e Chiffre : classe classes selon le type de réaction catalysée Oxydoréductases Oxydation ou réduction de substrat (transfert de proton et d'électrons) Déshydrogénases Réductases Oxydases 2 Transférases Transfert d'un groupement (amino, acétyl, phosphate) Aminotransférases Transacétylases Kinases 3 Hydrolases Hydrolyse d'une liaison (peptidique, ester, glycosidique) Eau : nucléophile Osidases Glycosidases esterases peptidases 4 Lyases Réactions d'addition ou réaction d'élimination Addition d'eau à un double lien (réversible) Élimination de gaz carbonique du substrat (réversible) Hydratases déhydratases décarboxylases 5 Isomérases Réarrangement moléculaire Racémases cis-trans isomérases mutases 6 Ligases Formation de liaison covalente couplée à une dépense énergétique (ATP, nucléoside tri-P) Synthétases Carboxylases 1. [...]

[...] Enzymologie I. Propriétés générales des enzymes Catalyseurs biologiques protéiques : augmentent la vitesse en diminuant l'énergie d'activation, sans modifier l'équilibre thermodynamique de la réaction. Exemple : H2O + CO2 = H2CO3 Sans catalyseur : 0,13 moles de CO2 transformées par seconde Anhydrase carbonique (hématies) : 106 moles par seconde Accélération de 7.107 fois Spécificité d'une enzyme vis-à-vis : - De type de réaction catalysée. - Spécificité pour le substrat. Exemple : trypsine (protéase) coupe les liaisons peptidiques et reconnait les acides aminés basiques (Lys, Arg). [...]

[...] Mg2+ : mise en conformation de l'ATP pour l'action des hexokinases. Zn2+ : participe à la catalyse Coenzymes - Molécules organiques de faibles MM, thermostable - Libres (exNAD+) dialysable - Ou liés de manière covalente à l'enzyme (groupement prosthétique) : hème des cytochromes FAD de la succinate Déshydrogénase. Coenzymes d'oxydoréduction Coenzyme Précurseur Fonctions NAD+ nicotinamide adénine dinucléotide Acide nicotinique vitamine B3 ou pp oxydoréduction FAD flavine adénine dinucléotide Riboflavine Vitamine B2 oxydoréduction Les ferro-porphyrine (hème) oxydoréduction (Fe2+/Fe3+) NAD+/NADH,H+ Nicotinamide adénine dinucléotide : nicotinamide mononucléotide (NMN) + AMP (adénosine monophosphate) NMN AMP adénine NADP se trouve souvent dans les voies de synthèse anabolique. [...]

[...] Coli et celle d'Aspergillus niger). Choix du pH tampon est primordial pour l'étude d'une réaction enzymatique La température loi d'Arrhénius : kc = A . e(-Eactivation/RT) A : constante (probabilité et nombre de chocs) R : constante des gaz parfaits Agroalimentaire Modification des farines texture pâte, volume, élasticité Lipooxygénase protéase Oxydation des AG insaturés : blanchir la mie abaisser élasticité de la pâte Transformation des produits laitiers (fromage) Présure : chymosine lipases Hydrolyse caséine déstabilisation des micelles et coagulation Arôme Fabrication des jus de fruit, vinification Pectinases Clarification Transformation des viandes Protéases : papaïne Tendreté des viandes Conservation des aliments Lysozyme Anti-bactérien Domaine médical et pharmaceutique Aide au diagnostic : déceler une pathologie Dosage d'enzyme : Alanine aminotransferase : activité augmentée Exemple : cirrhose, cancer du foie, hépatites. [...]