Fiche de Microbiologie (PCEM1)

Résumé du document

I] Le concept de procaryotes

- Bactérie = être unicellulaire, micro-organisme, procaryote.
. Procaryote = cellule unique, absence de membrane nucléaire, absence de processus mitotique.
. Rapidité de croissance.
. Capacité d'adaptation à l'environnement.
Adaptation physiologique = individu bactérien -> opérons (unité d'expression génétique coordonnée), régulons (opérons impliqués ds même fonction), modulons (opérons impliqués ds fonctions voisines), stimulons (opérons différents => réaction).
Adaptation génétique = population des bactéries.
. Outils d'expérimentation = biochimie, microbiologie médicale et vétérinaire, génétique, biologie moléculaire, biotechnologies.
. Rapport entre procaryotes et hôtes.
Bactéries des flores = sprophytisme (indépendance), commensalisme (dvp au contact des cellules eucaryotes sans effet délétère pour l'hôte).
Bactéries agent de maladies infectieuses = parasitisme (dvp aux dépens de l'hôte : facteurs de virulence, ilôts de pathogénicité).

- Classifications anciennes = règne animal / règne végétal, de Haeckel, de Stanier, de Whittaker.

- Classifications modernes = horloges moléculaires, ARNr de la petite s.u du ribosome.

II] La paroi bactérienne

- Structure bactérienne : taille variable (...), morphologie sphérique, en bâtonnet ou hélicoïdale.

- Structures bactériennes essentielles et facultatives.
. Essentielles = paroi, membrane cytoplasmique, appareil nucléaire.
. Facultatives = capsule, plasmides, flagelles, pili et fimbriae.

- La paroi bactérienne -> coloration de Gram
. Rôles = forme, protection, interface avec milieu extérieur et avec cellules hôtes, cibles des antibiotiques.
. Coloration de Gram -> Gram + / Gram - (plus complexe).

- Peptidoglycane ou muréine :
. Composition = chaînes glycaniques, tétrapeptides, ponts interpeptidiques. (Gram + = plus riche, plus réticulé / Gram - = moins riche, moins réticulé).
. Synthèse = étape cytoplasmique -> étape membranaire -> étape pariétale (cible de nbreux antibiotiques = fosfomycine, glycopeptides, bêta-lactamines).
. Fonctions = forme, rigidité, solidité, sensibilité au lysozyme, cible des antibiotiques, fixation macromolécules pariétales, vecteur d'antigène, structure poreuse.

III] Les autres macromolécules de la paroi des bactéries à Gram +

- Peptidoglycane = 50%.

- Acides teichoïques, teichuroniques, lipoteichoïques.
. (...)

Extraits

[...] Pili de type IV : piline principale PilE, mobilité par glissement. Pili conjugatifs = pli sexuels, pilus F et E.Coli VII] Nucléoïde et réplication Structures génomiques de la bactérie = génome, réplication, expression génétique, évolution génétique. Nucléoïde Plasmides L'appareil nucléaire ou nucléoïde = dépositaire majeur de l'information génétique, pas de membrane nucléaire, division Chromosome unique et circulaire le plus fréquent, taille variable. Composition : ADN, ARN, Protéines ADN 60% = 4 désoxyribonucléotides structure II ou III ARN 30% = produits de transcription (ARNm, ARNt, ARNr) Protéines 10% = ARN polymérase Organisation en domaines surenroulés Réplication : oriC terC pb/s Protéine initiatrice DnaA Hélicase Protéine ssb Primase ADN pol III (brins principal et retardé) ADN pol I Ligase, Topoisomérases Transcription Traduction Recombinaison Gènes opérons VIII] Les plasmides bactériens Fonctions diverses = fertilité (plasmides conjugatifs, facteur opéron Tra), résistance aux antibiotiques, chaînes métaboliques, facteurs de virulence. [...]

[...] Composants facultatifs = enveloppe + tégument. Les génomes viraux = virus à ADN ou à ARN, simple ou double brin, segmenté ou non, linéaire ou circulaire, polarité pour les virus à ARN = immédiatement traductible ; - = copie en brin positif avant traduction). Régions codantes = protéines structurales et non structurales. Régions non codantes = régulatrices La capside virale = protéique, protège le génome, polymérisée, sites d'attachement au récepteur. Capsides à symétrie icosaédrique (cubique) = sommets pentamères, faces/arêtes hexamères, nombre de triangulation T (nbre s.u = 60xT) Capsides à symétrie hélicoïdale (tubulaire) = plantes et bactéries le plus souvent, virus à animaux ARN le plus souvent négatif, toujours enveloppés. [...]

[...] FICHE MICROBIOLOGIE Le concept de procaryotes Bactérie = être unicellulaire, micro-organisme, procaryote. Procaryote = cellule unique, absence de membrane nucléaire, absence de processus mitotique. Rapidité de croissance. Capacité d'adaptation à l'environnement. Adaptation physiologique = individu bactérien opérons (unité d'expression génétique coordonnée), régulons (opérons impliqués ds même fonction), modulons (opérons impliqués ds fonctions voisines), stimulons (opérons différents réaction) Adaptation génétique = population des bactéries. Outils d'expérimentation = biochimie, microbiologie médicale et vétérinaire, génétique, biologie moléculaire, biotechnologies. [...]

[...] Facultatives = capsule, plasmides, flagelles, pili et fimbriae. La paroi bactérienne coloration de Gram Rôles = forme, protection, interface avec milieu extérieur et avec cellules hôtes, cibles des antibiotiques. Coloration de Gram Gram + / Gram (plus complexe) Peptidoglycane ou muréine : Composition = chaînes glycaniques, tétrapeptides, ponts interpeptidiques. (Gram + = plus riche, plus réticulé / Gram - = moins riche, moins réticulé) Synthèse = étape cytoplasmique étape membranaire étape pariétale (cible de nbreux antibiotiques = fosfomycine, glycopeptides, β- lactamines) Fonctions = forme, rigidité, solidité, sensibilité au lysozyme, cible des antibiotiques, fixation macromolécules pariétales, vecteur d'antigène, structure poreuse. [...]

[...] Étapes précoces du cycle. Attachement = facteurs d'attachement (virus nus protéines de capside, virus enveloppés glycoprotéines d'enveloppe de fusion), reconnaissance du récepteur cellulaire Entrée par fusion (virus enveloppés) ou endocytose (clathrines/cavéolines, décapsidation par fusion enveloppe virale / endosome). Décapsidation à la membrane plasmique ou membrane nucléaire. Étapes tardives du cycle. Synthèse des protéines structurales de capside et d'enveloppe. Assemblage des nucléocapsides virales dans le cytoplasme ou le noyau. [...]