Classification "classiques" = (seules réellement admises jusqu'au XXème siècle) regroupent dans des ensembles de plus en plus restreints (embranchement, classe, ordre, famille, genre et espèce), EV qui se ressemblent le plus selon critères morphologiques, physiologiques et écologiques directement observables.
A partir XVIIIème siècle, similitudes inattendues entre EV classés classiquement dans groupes très différents sont mis en évidence par études anatomiques, biologiques, embryologiques et plus récemment moléculaires (...)
[...] Intérêts : Du fait du caractère aléatoire des innovations génétiques, toutes les molécules ont statistiquement la même probabilité d'en subir mais d'en conserver dépend étroitement de l'importance du maintien de leur structure primaire et tertiaire dans leur fonction d'où des vitesses dévolution apparente très différentes d'une molécule à l'autre Détermination de la séquence ancestrale Aussi hypothétique que l'AC. On peut chercher à l'établir en considérant selon les principes de parcimonie maximale que les AA ou les bases le plus souvent représenté à une position donnée étaient ceux présent dans la séquence ancestrale Classification classique et phylogénétique 1. Intérêt des classifications phylogéniques La recherche d'état dérivé de caractère homologue permet de retrouver des parentés entre des EV actuellement si différents que les classifications classiques placent des groupes très distincts. [...]
[...] Exemple : Dipneuste Vache Saumon 2. Notion de groupes phylétique Groupe monophylétique = Ensemble contenant un AC exclusif et la totalité de ces ancêtres communs Groupe paraphillétique = Si un groupe n'est constitué que d'une partie des descendants des AC. [...]
[...] L'admission de ces liens de parenté a donné lieu à de nouvelles classification appelé phylogénies. Elles n'ont plus pour objectif de assembler dans un même groupe les EV qui se regroupent le plus mais ceux qui ont les liens de parenté les plus étroites possibles entre eux. Arbre phylogénétique = Relie successivement par des branches issues de nœuds représentants des AC hypothétiques, toutes espèces dites sœurs qui partagent exclusivement les mêmes innovations génétiques reçu héréditairement Recherche de liens de parenté et phylogénie chez les vertébrés à partir de données anatomiques, embryologiques et morphologiques 1. [...]
[...] Plus ils possèdent de caractères dérivés communs, plus ils ont apparentés et plus les branches sont courtes. Le nœud entre deux branches matérialise un AC exclusif hypothétique aux espèces et l'acquisition des états dérivés partagés - Principe de parcimonie maximale : minimum total d'évènement évolutifs nécessaires et surtout du minimum de répétitions indépendantes du même évènement pour deux espèces ou deux groupes distincts 5. Définition de l'AC AC exclusif = Ensemble des caractères dérivés partagés exclusivement par les espèces qui lui sont reliés postérieurement. [...]
[...] Sélection et interprétation des caractères informatifs 1. Différence entre caractère homologues et caractères analogues Caractère homologue : Caractères appartenant à des espèces différentes et qui ont évolué à partir d'un même caractère ancestral. Caractère analogue : Similitude apparente fondés sur aucune origine embryonnaire commune, ne traduisent d'une convergence de forme et des innovations indépendantes pour une adaptation à un même milieu et à une même fonction Polarisation des caractères homologues Définir une homologie entre deux formes apparemment très différentes d'un même caractère implique que l'une d'elle corresponde à un état d'évolution dit ancestral (=primitif) et donc que l'autre forme proviennent de sa transformation par innovation génétique constituant ainsi un état dit dérivé (=évolué). [...]
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