Le cytosol (PCEM1)

Résumé du document

I] Généralités

- Encombrement moléculaire.
. Utilisation de la tomographie à électrons.
. Reconstitution numérique à partir de coupes de ME.
. Ici : coloration des filaments d'actine (rouge) et ribosomes (vert).
. Chaque macromolécule est située à moins d'1/4 de son diamètre d'une autre molécule.
. Exemple du Golgi : (...)

- Dégradation des constituants cellulaires :
. Turn over « domestique ».
. Turn over spécifique.
. Réponse de l'environnement.
. Compartimentation de la portéolyse : lysosome ou protéasome.
. Rôle de l'ubiquitine +++.

II] Protéasome et ubiquitinylation

- Protéasome.
. Protéase multicatalytique.
. Composé d'un core qui porte l'activité catalytique (20S) et d'une partie régulatrice (19S).
. Le core comporte des couronnes plus ou moins nombreuses suivant les espèces.
. Digère les protéines ubiquitinylées.

- Complexité génétique et structurale :
(...)

Extraits

[...] Les résidus Lys sont ubiquitinylés. Destruction dans le protéasome. Cf CFTR. Les différents rôles de l'ubiquitine. Internalisation de protéines membranaires pour destruction. Ciblage de protéines du Golgi pour destruction. Internalisation de virus. Dégradation par le protéasome. Ciblage de protéines membranaires pour le lysosome. Fonctions non protéolytiques diverses. III] Autophagie Généralités. Balance entre la biosynthèse et le catabolisme. Pour la dégradation, la cellule eucaryote utilise le protéasome ou l'autophagie. Seule l'autophagie peut dégrader des organites entiers. L'autophagie contribue au turn over de routine. [...]

[...] Utile pour continuer l'autophagie après période de jeûne. Résumé Mort programmée Mort cellulaire programmée : accumulation de vésicules d'autophagie. Souvent observée quand une élimination massive cellulaire est nécessaire. L'autophagie pourrait aboutir à la mort cellulaire quand la capacité d'adaptation par autophagie est dépassée. Les différents types de mort cellulaire : Pathologie Balance entre rôle favorable et défavorable : Exemple d'une infection bactérienne : Entrée par phagocytose. Lyse de la membrane du phagosome. Séquestration par autophagie. Délai de fusion avec les lysosomes. Réplication. Apport de nutriments. [...]

[...] Fusionne avec un lysosome. L'autophagosome ne contient aucune activité hydrolase. Ces activités sont introduites par fusion avec des lysosomes. Dégradation des composants internalisés. Résumé : Autophagie non sélective (jeûne). Autophagie sélective (organites abîmés). Caractéristiques de la macro-autophagie. Routage de matériel cellulaire jusqu'aux lysosomes pour recyclage. Mise en évidence et caractérisée sur la levure. Très conservée de la levure à l'homme (induction, candidats moléculaires). Rôles : Maintenance : un programme constitutif dont l'activité participe à l'homéostasie (dégradation des protéines résidentes et organelles sénescentes). [...]

[...] Protéase multicatalytique. Composé d'un core qui porte l'activité catalytique (20S) et d'une partie régulatrice (19S). Le core comporte des couronnes plus ou moins nombreuses suivant les espèces. Digère les protéines ubiquitinylées. Complexité génétique et structurale : Ubiquitinylation des protéines. Ubiquitine : chaîne de 76 aa. Addition covalente d'ubiquitine par une cascade d'enzymes E2, EZ3) sur des Lys. Nécessite de l'ATP. Au moins 4 ubiquitines sur protéine. Ce sont les ubiquitines qui sont reconnues par le protéasome. Digestion par le protéasome. [...]