Les trafics internes

Résumé du document

Cours de biologie sur les trafics internes aux cellules et à l'organisme. Le cours est essentiellement composé de graphiques et schémas explicatifs. Document de 25 pages environ au format Acrobat.

Extraits

[...] RECYCLAGE DES PROTÉINES & DES LIPIDES Continuité de la spécificité du trafic intra-cellulaire : les membranes doivent conserver leur identité = les membranes doivent être recyclées (lutter contre l'homogénéisation des membranes) ENDOCYTOSE ASSISTÉE PAR RÉCEPTEURS extérieur cytoplasme CLATHRINE & ADAPTATEURS Particules d'adaptation - AP 1 : RTG (di-Leu) - AP 2 : mb plasmique (AP : RTG clathrine) Interactions avec cargo et clathrine membrane, FORMATION DES VÉSICULES A CLATHRINE cytoplasme récepteur clathrine (triskèles) particule adaptation (adaptateur) ARF membrane plasmique ligand ligand (ligand = hormone, facteur de croissance, protéine ou complexe macromoléculaire) ligand milieu extracellulaire Reconnaissance du ligand et initiation de la formation de la cage de clathrine adaptateur clathrine membrane plasmique cytosol extérieur récepteur ligand Formation d'un puits recouvert (clathrin-coated pit) Polymérisation des triskèles de clathrine en un réseau concave qui lève la membrane = Signal d'endocytose : motif porté par le récepteur, exposé du côté cytosolique et reconnu par l'adaptateur = motif TYROSINE (sert également à diriger le récepteur après endocytose : recyclage vers la mb plasmique ou dégradation par le lysosome) LIBÉRATION DE LA VÉSICULE = DYNAMINE-GTP ENDOSOMES = DYNAMINE-GDP Microtubule Dynamine : PL acides, Amphiphysine, AP2 x 75 GTP GDP + Pi LA VOIE DE SÉCRÉTION Pour toute protéine destinée à être sécrétée ou intégrée dans la mb plasmique (ou toute autre endomembrane du RE, Golgi, Les protéines transitent obligatoirement par le RE et le Golgi avant de s'installer ou de franchir la mb plasmique. [...]

[...] Enzyme : OST (oligosaccharyl transferase) = Ribophorine I + Ribophorine II + OST 48. [...]

[...] pH intra-lysosomial maintenu à (pH du cytosol : grâce à des pompes à protons (ATPases membranaires) protection (glycoprot) pH 7,2 pH 5,0 ATPase membranaire TRAFIC DES PROTÉINES - NOTION DE SIGNAL noyau ADN mARN cytoplasme traduction (stock de ribosomes) protéines cytosol mitochondrie noyau mb plasmique Nécessité pour les protéines d'avoir des signaux de routage (séquences d'acides aminés), reconnus spécifiquement par des machineries protéiques, afin de les guider vers leurs destinations Signaux en série = "FEUILLE DE ROUTE" noyau nucléole, centromère, séquences d'ADN mitochondrie matrice, mb int ou ext, espace inter-mb Golgi cis, médian, trans RTG membrane plasmique, endosome, lysosome TRAFIC DES PROTÉINES - ROUTES La synthèse de toutes les protéines cellulaires débute sur des ribosomes cytosoliques standard : destination / signal Cytosol Aucun signal requis : le ribosome termine la synthèse dans le cytosol Voie de sécrétion (RE-Golgi-mb plasmique) Signal = "peptide signal" en N-terminal (ribosome mb RE protéine synthétisée et déversée dans le RE Passage d'un compartiment (cpt "donneur") au suivant (cpt "receveur") par l'intermédiaire de vésicules = trafic vésiculaire = Voyage organisé et Transport en commun Noyau, mitochondrie, chloroplaste, peroxysome Signal = NLS (Nuclear Localization Sequence) MTS (Matrix Targeting Signal) (N-term) PTS (Peroxisome Targeting Signal) (N-term) Le ribosome achève sa synthèse dans le cytosol. [...]

[...] Golgi (1898 / neurones) Nobel 1906 (avec R. Y Cajal) = Ensemble de DICTYOSOMES Dictyosome = empilement de citernes membranaires (saccules) circulaires et aplaties (Ø = 1 µm, nb = 4 à entourées de nombreuses vésicules (Ø : 60-65 nm) qui bourgeonnent à leur périphérie Saccules vectorisés : face d'entrée - Le Cis-Golgi reçoit les vésicules venant du RE Cis - Le trans-Golgi expédie les Médian vésicules vers la mb plasmique Trans face de sortie (de maturation) Cis, médian et trans = 3 cpts indépendants (équipement enzymatique spécifique) Rôle : complète les modifications des protéines de la voie de sécrétion (glycosylations, ) et trie les protéines pour les expédier vers différentes destinations - Réseau cis-golgien : entre RE et cis-Golgi éléments de transition du RE, compartiment intermédiaire) - Réseau trans-golgien : en aval du trans-Golgi = centre de tri et de routage des protéines en provenance : - du trans-Golgi - de la mb plasmique par endocytose, via les endosomes LES LYSOSOMES C. [...]

[...] Les protéines du RE qui, après exportation vers le Golgi, doivent retourner dans le RE possèdent un "signal de récupération" : Lys-Lys (dans les 6 aa C-term). Ce signal est reconnu par le manteau COP I (rétrograde) MODIFICATIONS DES GLYCOPROTÉINES Séquence consensus de N-glycosylation : Asn - X - Ser/Thr = aa sauf Pro) Structure : "Asparagine turn". [...]