Les techniques d'identification bactérienne

Résumé du document

TP de biologie portant sur les techniques d'identification bactérienne. L'objectif de ce TP est d'apprendre les techniques permettant l'identification des différentes bactéries. Ce travail d'identification est fractionné en plusieurs étapes la première et la plus importante étant l'isolement et la purification de la souche à étudier, cette étape à été réalisée au laboratoire par le préparateur et non par les étudiants. Nous avons procédé à l'identification en quatre étapes dépendantes les unes des autres, d'abord l'examen macroscopique, puis l'examen microscopique, ensuite la galerie de famille et pour finir la galerie de genre.

Extraits

[...] Pour cela, on retourne le tube délicatement, si le plasma ne coule pas, c'est qu'il y a eu coagulation sinon il reste liquide. Nous n'avons pas pu observer de résultat car l'incubation a durée trop longtemps donc on ne peut pas savoir si les résultats sont fiables Mise en évidence de la Dnase Pour cela on utilise ne gélose contenant e l'ADN Protocole Etape 1 : On effectue ne strie large sur la gélose avec l'oëse (attention la strie ne doit être ni trop large ni trop fine cela entraînerait une mauvaise interprétation des résultats) Etape 2 : On incube la gélose pendant 24heureà 37°C. [...]

[...] Etape 5 : Pour pouvoir lire les résultats il fat ajouter des réactifs dans certaines cupules Résultats Pour la lecture des résultats il a fallu prendre en compte le fait qu'on a laissé incuber les galeries 48 heures alors que le fournisseur conseille 24 heures. Pour faciliter la lecture on compare les galeries des deux souches, puis on c'est référé au tableau de lecture du fournisseur en regardant bien les petites lignes. Les résultats sont transformés en code numérique selon un système de coefficients donné par le fournisseur. On obtient au final n biocode et on peut identifier la souche testée en se référant à un catalogue analytique. Pour la souche on a trouvé 5144552. [...]

[...] Elle contient en effet un indicateur coloré qui change en fonction de l'acidité du milieu. Si la gélose devient jaune, le milieu a été acidifié ce qui signifie que les bactéries ont utilisé du lactose : elles sont lactose + Résultats En suivant le protocole précédant j'ai obtenu les résultats suivants sur les quatre souches à identifier. II. L'examen microscopique Les deux études microscopiques fondamentales sont l'examen l'état frais et la coloration de Gram L'examen à l'état frais L'examen à l'état frais renseigne surtout sur la mobilité, la morphologie et le groupement des bactéries Protocole Etape 1 : Etape 2 : Etape 3 Dilution de la colonie dans la goutte de MgSO4 Etape 4 : cette étape évite les contaminations Etape 5 : La dernière étape est l'observation elle se fait sur un microscope optique à l'objectif 40 (c'est à dire au grossissement 400) sans huile à immersion. [...]

[...] TP Microbiologie Introduction : L'objectif de ce TP est d'apprendre les techniques permettant l'identification des différentes bactéries. Ce travail d'identification est fractionné en plusieurs étapes la première et la plus importante étant l'isolement et la purification de la souche à étudier, cette étape à été réalisée au laboratoire par le préparateur et non par les étudiants. Nous avons procédé à l'identification en quatre étapes dépendantes les unes des autres, d'abord l'examen macroscopique, puis l'examen microscopique, ensuite la galerie de famille et pour finir la galerie de genre. [...]

[...] Ce domaine évolue très rapidement, et l'avenir est à l'étude des bactéries non plus à partir de leur phénotype, mais en se plongeant directement dans leur génotype (PCR). Dans tous les cas, il est primordial d'être assuré d'avoir réussi l'isolement de la bactérie avant de se lancer dans des techniques d'identification qui passent par des protocoles de plus en plus coûteux, et qui seraient inefficaces si l'isolement n'est pas réussi. CMI :Concentration minimale inhibitrice. Elle est propre a chaque antibiotique par rapport aux souches bactériennes. [2]Ccsup : Correspond au taux maximum d'antibiotique retrouvé dans le sang aux posologies habituelles. [...]