Biodiversité, organisme Eucaryote, évolution biologique, eucaryote, flagelles, Amibozoaires, Archaeplastida, Chromoalvéolés
Généralités sur les eucaryotes. Les principaux groupes d'eucaryotes et leurs caractères dérivés partagés. L'endosymbiose mitochondriale.
Les eucaryotes photosynthétiques :
- les algues (les endosymbioses ; notions de cycle de développement et d'alternance de phases)
- les plantes ou embryophytes Origine évolutive. Evolution du cycle de développement
Les eumycètes (« vrais » champignons).
Les métazoaires. Principaux embranchements. Les grands plans d'organisation.
[...] Mycétozoaires ou Myxomycètes. Amibes sociales Eucaryotes non photosynthétiques à forme amiboïde ou flagellée. Les cellules peuvent s'assembler en un plasmode, ou masse multicellulaire ou multinuclée, parfois visible à l'œil nu. Reproduction sexuée quand le milieu devient défavorable (formation de spores). Espèce bien connue : Dictyostelium, discoideum, dont le signal morphogénétique est l'AMP cyclique. Caractères dérivés partagés : alternance de phases uni- et pluri- cellulaires, les gènes cox 1 et cox 2 (cytochrome oxydase) sont fusionnés dans le génome mitochondrial, et le gène du facteur d'élongation EF1 α porte des caractères partagés. [...]
[...] Très souvent parasites de toutes sortes de métazoaires. Caractères dérivés partagés : une disposition des flagelles très particulière (un flagelle est orienté postérieurement) Euglénobiontes Regroupe d'anciens embranchements d'unicellulaires apparemment très différent (euglènes photosynthétiques trypanosomes, et des ciliés primitifs S'il y a des chloroplastes, ils sont apparentés à la lignée verte. Caractères dérivés partagés : crêtes des mitochondries (en forme de raquette de ping-pong), gènes du cytochrome des ARN 5S et 18S. Les euglènes vivent en eau douce, se nourrissant de déchets organiques, et celles qui sont photosynthétiques montrent un héliotactisme. [...]
[...] Selon la localisation du symbionte dans son hôte Ectosymbiose Endosymbiose Eléments en faveur de l'origine endosymbiotique des mitochondries et des chloroplastes: Les nouvelles mitochondries et chloroplastes se forment uniquement par division Leurs génomes (souvent 1 molécule d'ADN circulaire) possèdent des gènes plus proches des gènes procaryotes que des gènes eucaryotes Gène du cytochrome C Alphaproteobacteria Cyanobacteri Ribosomes de type bactérien pour la synthèse de leurs protéines Organites entourés par une double membrane (pour les chloroplastes des Archaeplastida) Conclusions sur la phylogénie des eucaryotes La phylogénie des eucaryotes n'est pas encore complètement résolue: . Il y a un petit nombre de grands groupes . La monophylie des Opisthochontes (Métazoaires + Eumycètes + Choanoflagellés) est claire comme celles des Archaeplastida (origine unique des eucaryotes photosynthétiques primaires) et celle des Amibozoaires d'une part, des Rhizaria d'autre part . Mais il y a encore des incertitudes sur les Excavés et les Chromoalvéolés . [...]
[...] Evolution des eucaryotes . Age : ~ 1,5 milliard d'années . Evolutivement éloignés des bactéries et des archées . Durée de la diversification relativement brève par rapport au temps écoulé depuis leur apparition : pas de groupe clairement raciné en bas de l'arbre . Diversité moléculaire relativement faible par rapport à celle des bactéries ou des archées (mais considérable diversité morphologique) . Une symbiose mitochondriale, plusieurs symbioses chloroplastiques . La cellule, comme son génome nucléaire, sont des chimères, à cause des endosymbioses et des transferts horizontaux . [...]
[...] Les arguments en faveur de l'évolution biologique . La classification des espèces : classifications naturelles phylogénétiques (cf. cours P. Capy) . La paléontologie (attention : les fossiles ne sont pas des intermédiaires disparus entre espèces vivantes, mais entre un ancêtre et des espèces vivantes ou disparues) . Le plus souvent, les espèces morphologiquement proches sont géographiquement proches . L'anatomie comparée, l'embryologie et la mise en évidence d'homologies (cf. cours Capy) . La domestication des espèces . L'évolution observée dans la nature . L'ADN (cf. cours P. [...]
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