I ? Qu'est-ce que le séquençage de l'ADN ?
1.1 Définition
Le séquençage de l'ADN c'est la lecture du patrimoine génétique d'un organisme. Chaque être vivant est formé de cellules. Chaque cellule contient un noyau où se localise l'ADN. Cet ADN est formé de bases, des composés chimiques nommés Adénine, Cytosine, Thymidine et Guanine. Ces composés chimiques formant l'ADN sont notés respectivement A, C, T et G et s'enchainent dans un ordre particulier constituant les gènes. Ce sont ces gènes qui codent nos protéines. Ainsi le séquençage de l'ADN c'est la détermination dans l'ordre de ces bases A, T, G ou C pour les gènes de chaque individu.
1.2 Pour quelles raisons séquencer l'ADN ?
Le séquençage de l'ADN a permis des progrès considérables de la science au XXème siècle. Ainsi le séquençage de l'ADN humain a révélé l'origine de certaines maladies génétiques. Par exemple, on sait désormais que la drépanocytose est une maladie génétique liée à une modification de l'ADN codant l'hémoglobine, une protéine permettant à l'oxygène de circuler dans le sang. Le séquençage du génome complet de très nombreux organismes vivants a permis aux naturalistes de révolutionner la classification du monde vivant en révélant des proximités génétiques entre organismes qui n'étaient pas soupçonnées par la simple observation de caractères morphologiques. (...)
[...] Il s'agit d'une technologie très répandue. Mais on peut tout de même noter l'une des compagnies pionnière les plus célèbres dans ce domaine : Celera Genomics, fondée par Craig Venter. Elle s'est opposée à un consortium de laboratoires publics pour être la première à séquencer l'ADN humain dans une course technologique restée célèbre. Finalement un accord a été trouvé entre les concurrents pour publier en l'an 2000 dans la célèbre revue scientifique Science la séquence du génome humain. II Comment séquencer l'ADN ? [...]
[...] Ainsi, sur chaque microbille, chaque molécule d'ADN attachée est amplifiée. - Etape Les microbilles avec leurs molécules d'ADN sont placées dans un micro-puits sur une plaque de séquençage. - Etape C'est la réaction de séquençage proprement dite. Les ADN sur les microbilles sont sous forme simple brin, et une polymérase va ajouter les nucléotides complémentaires manquants. La microplaque est parcourue par un flux de dATP, puis de dCTP, puis de dATP, puis de dGTP. Lorsque le nucléotide manquant est additionné par la polymérase, un complexe enzymatique partenaire, comprenant entre autres une luciférase, produit un éclair de lumière, détecté par un ordinateur. [...]
[...] Le séquençage de l'ADN I Qu'est-ce que le séquençage de l'ADN ? 1.1 Définition Le séquençage de l'ADN c'est la lecture du patrimoine génétique d'un organisme. Chaque être vivant est formé de cellules. Chaque cellule contient un noyau où se localise l'ADN. Cet ADN est formé de bases, des composés chimiques nommés Adénine, Cytosine, Thymidine et Guanine. Ces composés chimiques formant l'ADN sont notés respectivement T et G et s'enchainent dans un ordre particulier constituant les gènes. Ce sont ces gènes qui codent nos protéines. [...]
[...] Une électrophorèse subséquente permet de séparer les brins en fonction de leur taille, reflet de la séquence d'ADN. La lecture de cette électrophorèse permet de reconstituer la séquence d'ADN d'intérêt Les méthodes récentes haut débit de séquençage de l'ADN Ces méthodes récentes, comme le célèbre pyroséquençage 454 permettent de séquencer l'ADN à très haut débit. Ces nouvelles méthodes de séquençage haut débit sont très nombreuses, mais pour la plupart d'entre elles, on reconnaît 4 étapes : - Etape Chaque molécule d'ADN est accrochée à une microbille. - Etape Chaque microbille est placée dans une émulsion. [...]
[...] Ainsi elles permettent aujourd'hui de séquencer en quelques heures le génome d'une bactérie Et demain, comment séquencera t'on l'ADN ? Il est toujours très difficile de faire de la biologie prédictive, cependant quelques pistes se dessinent déjà lorsque l'on observe les directions de recherches actuelles. Toutes les méthodes de séquençage futures seront bien plus performantes, plus rapides et moins couteuses que les actuelles. Elles permettront de séquencer en très peu de temps des quantités très importantes de gènes, à des vitesses probablement 10 à 1000 fois plus rapides qu'actuellement dans les 10 ans qui viennent. [...]
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